一、細胞的裂解
單層細胞的裂解
懸浮培養的細胞或組織單細胞懸液的裂解
a.單層細胞的裂解
a)吸出培養液,以7ml用冰預冷的無鈣鎂離子磷酸緩沖鹽溶液PBS沖洗細胞培養皿內的單層細胞,重復1次,將平板置于冰上直至所有單層細胞沖洗完畢。也可將平板放在一塊鋁板上,再將鋁板置于冰盤上。
b)直徑為90mm的培養皿需加0.5ml RNA提取緩沖液, 并使之遍布整個平板的表面。
RNA提取緩沖注液
0.14mol/L NaCL
1.5mmol/L MgCL2
10mmol/L Tris.CL(pH8.6)
0.5%NP-40
1mmol/L二硫蘇糖醇(DTT)
100單位/ml胎盤rna酶抑制劑或20mmol/L氧釩核糖核苷復合物
c)加0.5ml蛋白酶消化緩沖液,用刮棒混勻粘稠狀裂解物并將其刮到平板的邊緣。
蛋白酶消化緩沖液
0.2mol/L Tris.Cl(pH8.0)
25mmol/L EDTA(pH8.0)
0.3mol/L NaCl
2% SDS
d)用裝有21號針頭的皮下注射器抽吸細胞裂解物,再將其注入聚丙烯管內。重復3-4次,剪切DNA。
c)加蛋白酶K至終濃度為200μg/ml,充分混勻后置于37℃溫育30分鐘。
蛋白酶K以貯存液的形式保存,貯存液為20mg/ml 蛋白K溶液。
b.懸浮培養的細胞或組織單細胞懸液的裂解
a)于4℃以2000g離心5分鐘收集細胞,以10倍體積用冰預冷的無鈣鎂離子磷酸緩沖液懸沉淀,洗滌細胞3次,每次均用大口徑的吸管輕輕吹打細胞沉淀,使其*分散。
b)估計細胞沉淀的體積,用10-20倍體積的RNA提取緩沖液重懸之。
c)加入與步驟b)所加RNA提取緩沖液體相同的蛋白酶消化緩沖液,用振蕩器迅速混勻。用裝有21號針頭的皮下注射器抽吸細胞裂解物,再將其注入聚丙烯管內。重復3-4次,剪切DNA。
d)加蛋白酶K至終濃度為200μg/ml,充分混勻后置于37℃溫育30分鐘。蛋白酶K以貯存的形式保存,貯存液為20μg/ml蛋白酶K水溶液。
二、提取步驟
1)用等體積酚:仿抽提1次,以去除蛋白質。