美Agena 核酸質譜分析系統技術特點:
本系統的突出特點是以*的精確度和極快的速度,一次性掃描384個樣本中的多達40個SNP位點。首*行多重PCR擴增,然后有經過修飾的ddNTP作單堿基引物延伸,使質譜能夠準確識別堿基,并依據峰面積報告每個堿基的頻率。因此能夠準確分析樣本中的等位基因分布頻率,適用于遺傳性疾病檢測和體細胞突變檢測以及鑒別一個體的正?;蚰[瘤組織。MassARRAY 反應體系不需要雜交,可避免雜交錯配干擾,也不需要熒光標記。其采用的高密度SpectroCHIP 芯片能在8小時內完成3840個樣本的多重SNP鑒定,全自動分析結果,不受人為因素干擾。訪系統分為96孔和384孔2種不同通量和3種儀器型號供用戶靈活選擇,可滿足用戶低,中,高不同通量的使用需求。該系統的上市及時提供了從低到高不同規模的高效率和高質量檢測SNP的技術平臺,順應了當前醫學疾病基因組疾病機制研究和臨床診斷檢測迅猛發展的趨勢。
美Agena 核酸質譜分析系統技術原理
核酸質譜主要通過單堿基延伸和分子切割的兩種生物化學技術實現。
iPLEX SNP 基因型分析
Assay Designer 軟件對SNP的80-150bp區域設計多重PCR引物,并對SNP位點設計單堿基延伸引物。PCR擴增處理:5ul體系做1-40重反應,45個循環;產物經蝦堿性磷酸酶(SAP)處理。單堿基延伸擴增不同長度的1-40條引物,用ddNTP作用堿基延伸,200個循環。DNA質譜檢測和數據分析精確區分4種堿基的分子量,并自動報告其生物結果。
EpiTYPER DNA 甲基化分析
亞硫酸鹽將未甲基化的胞嘧啶轉變為*,PCR擴增和SAP處理用反鏈5端帶T7啟動的引物擴增500bp, 產物經蝦堿性磷酸酶(SAP)處理,體外轉錄將DNA轉錄為PRA, 堿基特異性酶切酶切T后, DNA 的片段的分子量取決于亞硫酸鹽處理后的堿基變化。
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