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江蘇晶美生物科技有限公司

解析lncRNA在重編程中的作用

時(shí)間:2015-6-12閱讀:203
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研究對(duì)于lncRNAs在重編程中的作用提供了*見(jiàn)解,并在p53和異染色質(zhì)之間建立了一種新的。

誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSCs)對(duì)于再生醫(yī)學(xué)、體外疾病模型和毒理學(xué)篩選有重要影響。然而,要達(dá)到這些預(yù)期,我們有必要了解重編程機(jī)制如何消除和重寫(xiě)體細(xì)胞表觀遺傳學(xué)編碼。這很重要,因?yàn)橹鼐幊毯苋菀壮鲥e(cuò),這可能會(huì)阻礙衍生細(xì)胞的生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用。

現(xiàn)在,通過(guò)外生因素的重編程,被認(rèn)為是一個(gè)多步驟的過(guò)程,在此過(guò)程中細(xì)胞必須克服一系列的障礙,zui終才能獲得多能性,但是在某種情況下它可能也是確定性的。兩個(gè)基本的重編程障礙是:p53介導(dǎo)的反應(yīng),可促進(jìn)細(xì)胞凋亡和細(xì)胞衰老;先存的體細(xì)胞樣表觀遺傳標(biāo)記的去除效率低下。因此,p53H3K9甲基轉(zhuǎn)移酶Setdb1Suv39h1Suv39h2的損耗,以及DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNMT1的抑制,可提高重編程的效率。

非編碼RNA在不同重編程障礙的構(gòu)建或刪除過(guò)程中,發(fā)揮著重要的作用。然而,盡管micrornA (miRNA)網(wǎng)絡(luò)在重編程中的廣泛表征,目前已知只有2個(gè)長(zhǎng)非編碼RNAs (lncRNAs)可調(diào)節(jié)這一過(guò)程。LncRNAs是不超過(guò)200個(gè)核苷酸的非編碼RNA種類,充當(dāng)誘餌、指南或支架的作用。LincRNA-RoR是*個(gè)與重編程有關(guān)的lncRNA。相反,lincRNA TUNANanogSox2Fgf4啟動(dòng)子區(qū)的幾個(gè)RNA結(jié)合蛋白,形成了一種復(fù)合物,在那里它有利于活性組蛋白標(biāo)記H3K4me3的沉積。

在這項(xiàng)研究中,通過(guò)表達(dá)譜和功能篩選,研究人員確定,大的基因間非編碼rna p21(lincRNA-p21)可損害重編程。值得注意的是,lincRNA-p21是由p53誘導(dǎo),但是并不促進(jìn)重編程中的細(xì)胞凋亡或細(xì)胞衰老。相反,lincRNA-p21H3K9甲基轉(zhuǎn)移酶SETDB1DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNMT1有關(guān),這是由RNA結(jié)合蛋白HNRNPK促進(jìn)的。因此,lincRNA-p21可通過(guò)維持多能性基因啟動(dòng)子的H3K9me3/CpG甲基化,阻止重編程。

在這篇論文成稿過(guò)程中,Dimitrova等人利用一種基因刪除方法證明,lincRNA-p21也順式作用以誘導(dǎo)p21表達(dá)并減少MEF增殖。與我們的研究工作相反,敲除掉MEFslincRNA-p21 之后,Huarte等人并沒(méi)有檢測(cè)p21表達(dá)的任何減少。Dimitrova等人還推測(cè),lincRNA-p21可通過(guò)增加p21,阻斷MEFsOSKM重編程,但是他們并沒(méi)有在此設(shè)置中量化細(xì)胞增殖。這種差異的一個(gè)可能解釋是,lincRNA-p21的*抑制,是解除p21所必需的。還需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)來(lái)澄清這一問(wèn)題,有可能lincRNA-p21是通過(guò)多種機(jī)制來(lái)調(diào)節(jié)重編程的。

總之,這項(xiàng)研究可以指導(dǎo)其他研究人員調(diào)查lncRNA在重編程中的作用,也指出了p53HNRNPKlincRNA-p21調(diào)節(jié)基因表達(dá)的一種新機(jī)制。未來(lái)的研究工作將進(jìn)一步探討,重編程過(guò)程中lincRNA所控制的網(wǎng)絡(luò),這將與迄今為止所確定的障礙形成新的。


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