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下一代測序技術為物種如何適應氣候變化提供見解

時間:2015-1-24閱讀:125
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遺傳學技術為環境生物學家提供了一種有價值的工具,用于追蹤種群對變化中的環境的適應。

環境科學家擁有了一個研究物種對環境變化的響應的新工具。下一代測序技術(NGS)已經讓非常迅速地分析大量DNA短片段變為可能,這種技術已經讓生物醫學科學發生了革命。希望在于下一代測序技術(NGS)通過為科研人員提供關于種群適應一個正在變化的世界的方式的新鮮見解,從而證明它在生態研究領域同樣有用。

在即將發表在3月號的《生物科學》(BioScience)雜志上的一篇論文中,都來自美國舊金山州立大學與加州大學伯克利分校的生物學家Jonathon H. Stillman 和Eric Armstrong描述了下一代測序技術(NGS)提供的機遇的特征:“下一代測序方法正在從根本上改變環境科學家進行研究的方式,這些研究是為了理解生物如何正在對氣候變化做出響應,或者如何可能在未來對氣候變化做出響應。"此外,這組作者主張,下一代測序技術(NGS)將能夠讓科研人員“以比此前任何時候更高的分辨率描述他們正在研究的種群的特征。"

下一代測序技術(NGS)的重要特征之一就是允許環境生物學家評估特定基因變體在地方種群中存在與否,這可能表明對特定的氣候適應性狀的選擇。也可以通過下一代測序技術(NGS)理解基因表達的改變,并且提供有關種群響應的進一步的信息。例如,在一個關于珊瑚的下一代測序技術(NGS)研究中,科研人員發現與細胞應激響應有關的基因在變得適應熱的種群中被下調了。Stillman 和 Armstrong說,這種CSR基因的下調“與提示維持這些基因的高水平表達存在一種進化成本的證據一致"。

盡管下一代測序技術(NGS)有這些前景,它在研究對環境變化的響應方面的應用可能受到缺乏資金的妨礙。與在醫學和農業企業領域的同行相比,環境生物學家獲得的資助較少,而下一代測序技術(NGS)是昂貴的。正如這組作者所說:“環境科學家大范圍采用下一代測序技術(NGS)將需要關于如何資助科研人員或科研協作體的新思維,這些科研人員正在試圖使用現有的工具去應對當今社會面臨的zui大問題之一,而應對這些問題的資金卻zui為缺乏——也就是理解和緩解氣候變化的影響。"

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