研究開發(fā)出高通量基因組編輯新技術

【資料簡介】

研究開發(fā)出高通量基因組編輯新技術
近日，雜志《自然—生物技術》Nature Biotechnology刊登了來自美國麻省總醫(yī)院研究人員的研究成果“FLASH assembly of TALENs for high-throughput genome editing，”，文章中，研究者開發(fā)了一項新技術，利用這一技術他們可以快速生成大量的轉錄激活因子樣效應物核酸酶（transcription activator-like effector nucleases ，TALENs），從而大大提高了研究人員敲除研究基因或改變它們表達的能力。

TALENs是一種可靶向特異DNA序列的酶，由于具有一些比鋅指核酸酶（ZFNs）更*的特點，現(xiàn)在成為了科研人員用于研究基因功能和潛在基因治療應用的重要工具。

研究開發(fā)出高通量基因組編輯新技術
“新技術實現(xiàn)了高通量生成TALENs，這將有可能*改變大量生物學研究的方式，讓所有的研究人員都能快速簡便地靶向敲除任何的目的基因，”文章的共同資深作者、麻省總醫(yī)院病理系研究副主任J. Keith Joung博士說。

TALENs是借助于TAL效應子，一種由植物細菌分泌的天然蛋白來識別特異性DNA堿基對的。TAL效應子可被設計識別和結合所有的目的DNA序列。對TAL效應子附加一個核酸酶就生成了TALENs。TAL效應核酸酶可與DNA結合并在特異位點對DNA鏈進行切割，從而導入新的遺傳物質(zhì)。相比于ZFNs，TALENs可以靶向更長的基因序列，并且相對更容易于構建。但是直到現(xiàn)在研究人員也沒有找到廉價、可供公眾使用的快速生成大量TALENs的技術。

在新文章中，Joung和同事開發(fā)了一種稱為FLASH（快速連接自動化固相高通量，fast ligation-based automatable solid-phase high-throughput）的系統(tǒng)，，通過液體處理機器實現(xiàn)自動化構建DNA，在一天內(nèi)可構建編碼多達96種TALENs的DNA序列，每個TALEN的成本約為75美元。此外，Joung還開發(fā)了一種手動的FLASH使得實驗室無需借助機器設備即可在一天構建24種TALEN序列。在人類細胞中測試這一系統(tǒng)，研究人員發(fā)現(xiàn)FLASH裝配TALENs能夠成功誘導已知參與癌癥或表觀遺傳學調(diào)控的96個靶基因中的84個基因斷裂。

文章的共同資深作者、Joung 實驗室研究人員Jeffry D. Sander 博士說：“我們發(fā)現(xiàn)85-90%的FLASH裝配TALENs在人類細胞中具有高度基因組編輯活性，表明我們能夠基本上靶向任何的目標DNA序列，其能力大大超越了其他的核酸酶。這種能夠生成靶向所有DNA序列的TALEN的能力將很有可能改變我們對于基因改造技術的思維方式，因為現(xiàn)在問題不再是你能否靶向你的目的基因，而是你希望靶向和改變哪些基因。”

研究小組還發(fā)現(xiàn)TALEN序列越長，對于細胞產(chǎn)生毒副效應的可能性就越小。他們猜測有可能是因為越短的TALENs越有可能結合和改變非目標基因位點。Joung指出這表明了設計較長TALENs用于未來研究和潛在治療應用的重要性。
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