上海酶聯生物研究所作者
Western Blot印跡常用的轉移膜主要是硝酸纖維素膜(Nitrocellulose Blotting Membranes,NC)和PVDF膜,此外也有用尼龍膜、DEAE纖維素膜做蛋白印跡。
選擇的根據主要有:
a. 膜與目的蛋白分子的結合能力(也就是單位面積的膜能結合蛋白的載量),以及膜的孔徑(也就是攔截蛋白的大小);
b. 不影響后續的顯色檢測(也就是適和用于所選的顯色方法,信噪比好);
c. 如果后繼實驗有其他要求,比如要做蛋白測序或者質譜分析,還要根據不同目的來挑選不同的轉移膜。
列表形式對主要的三種膜進行比較。
| NC膜 | 尼龍膜 | PVDF膜 |
靈敏度和分辨率 | 高 | 高 | 高 |
背景 | 低 | 較高 | 低 |
結合能力 | 80-110 ug/cm2 | >400 ug/cm2 | 125-200 ug/cm2(適合于SDS存在下與蛋白質的結合) |
材料質地 | 干的NC膜易脆 | 軟而結實 | 機械強度高 |
溶劑耐受性 | 無 | 無 | 有 |
操作程序 | 緩沖液潤濕,避免氣泡 | 緩沖液潤濕 | 使用*%甲醇潤濕 |
檢測方式 | 常規染色,可用放射性和非放射性檢測 | 不能用陰離子染料 | 常規染色, 比較于NC膜,可用考馬斯亮藍染色,可用于ECL檢測,質譜分析和快速免疫檢測。 |
適用范圍 | 0.45um 一般蛋白 | 0.2um一分子量小于20kD蛋白 | 0.1um一分子量小于7kD蛋白 低濃度小分子蛋白、酸性蛋白、糖蛋白和蛋白多糖(主要用在核酸檢測中) 糖蛋白檢測和蛋白質測序。 |
價格 | 價格較便宜 | 便宜 | 較貴 |
硝酸纖維素膜
硝酸纖維素膜是蛋白印跡zui廣泛使用的轉移介質,對蛋白有很強的結合能力,而且適用于各種顯色方法,包括同位素,化學發光(Luminol類)、常規顯色、染色和熒光顯色;背景低,信噪比高。NC膜的使用也很簡便,不需要甲醛預處理,只要在無離子水面浸潤排出膜內氣泡,再在電泳緩沖液中平衡幾分鐘就可以了;NC膜很容易封閉,也不需要特別嚴謹的清洗條件。轉移到NC膜上的蛋白在合適的條件下可以穩定保存很長時間,不過要注意的是純的硝纖膜在比較脆,又容易卷,操作要小心,不適合用于需要多次重復清洗的用途——因為經不起多次“折磨”。選擇硝纖膜時要注意的是選擇合適的孔徑,通常20KD以上的大分子蛋白用0.45um孔徑的膜,小于20KD的話建議選擇0.2um的,如果小于7KD的話選擇0.1um的膜。另外還要注意選擇純的NC膜——混有含醋酸纖維(CM)的NC膜結合力會有所降低。另外提醒一句:由于NC膜上結合的蛋白會因為一些去污劑而被代替,因此在封閉時使用較溫和的Tween20,而且濃度不要超過0.3%(據說0.05%效果)。一般而言,NC膜越純,其蛋白結合能力就越高,所以要增加WB的靈敏度和分辨率,提高所使用膜的純度是個可以考慮的選擇。如果NC膜攙雜一些醋化纖維素——這在前面已經提到,會影響蛋白質結合。Protran由于是純NC膜,比較脆,機械耐受力欠佳,需要小心操作,如果擔心自己“粗手粗腳”,那么就可以考慮一下Optitran或者Pall公司的以耐受力著稱的BioTrace NT Nitrocellulose Transfer Membrane。卷膜肯定是*的選擇,只不過要自己動手裁剪——切記,必須帶手套操作。
PVDF膜
與硝酸纖維素膜相比,PVDF膜在蛋白質截留能力,機械強度和化學相容性上都更*的性能。市售硝酸纖維素膜的典型結合量是80-100μg/cm2,而PVDF膜結合量是100-200μg/cm2(而結合強度PVDF比硝纖膜強6倍!)。但是PVDF膜zui大的優點不僅于此:更好的機械強度和化學耐受性使PVDF膜在各種染色應用和多重免疫檢測中成為理想選擇;而且單個凝膠的泳道復本可用于多種目的,特別是需要做N端蛋白測序,在相當“嚴酷”的清洗條件下,當尼龍或者硝纖膜已經降解的情況下PVDF膜依然保持本色,笑傲江湖。所以PVDF也是要做蛋白測序的*選擇。但不適合熒光。PVDF膜特別注意的是需要100%甲醇預處理(不超過15秒)再用緩沖液平衡,才能用,而且適用過程中萬一干了也要同樣程序再處理(不過要真出現這種問題也是自己欠扁,誰要你不小心呢,轉膜前處理也就罷了,轉膜后再這樣處理可能會影響后繼的抗體識別呢)。PVDF膜同樣分0.45um和0.2um的,后者孔徑小,對小分子蛋白有較好的攔截吸附,背景可能會比前者稍高。
卷膜經濟實惠,裁剪剩下的邊角料還可以用來做點雜交。再次強調的是,疏水PVDF膜在用前必須經過50%或以上體積比的甲醇或者乙醇溶液處理幾分鐘,待膜變成半透明后用純水漂洗一下,轉入電泳緩沖液平衡才能用。