工作原理：載氣（氧氣）經過凈化后，導入燃燒爐（電阻爐或高頻爐），樣品在燃燒爐高溫下通過氧氣氧化，使得樣品中的碳和硫氧化為CO2、CO和SO2，所生成的氧化物通過除塵和除水凈化裝置后被氧氣載入到硫檢測池測定硫。此后，含有CO2、CO、SO2和O2的混合氣體一并進入到加熱的催化劑爐中，在催化劑爐中經過催化轉換CO→CO2，SO2→SO3，這種混合氣體進入到除硫試劑管后，導入碳檢測池測定碳。殘余氣體由分析器排放到室外。與此同時，碳和硫的分析結果以%C和%S的形式顯示在主機的液晶顯示屏上和連接的計算機顯示器上并儲存在計算機里，以便隨時調出，也可以通過連接的打印機輸出打印。

　　裝有基于Windows軟件的計算機可以操作CS-2000碳硫分析儀。在分析過程中，為保證分析簡單可靠地執行，儀器可實時顯示工作狀態。樣品分析的燃燒釋放曲線同時顯示在計算機屏幕上。軟件具有自動校正和自動診斷功能。碳硫分析儀可以連接到實驗室信息管理系統（LIMS）。