1　物理處理法
1）過濾法
由于養殖廢水中的剩余殘餌和養殖生物排泄物等大部分以懸浮態大顆粒形式存在，因此采用物理過濾法去除是zui為快捷、經濟的方法。常用的過濾設備有機械過濾器、壓力過濾器、沙濾器等。在實際處理工程中，機械過濾器(微濾機)是應用較多、過濾效果較好的方式。沸石過濾器兼有過濾與吸附功能，不僅可以去除懸浮物，同時又可以通過吸附作用有效去除重金屬、氨氮等溶解態污染物。

12）泡沫分離法
泡沫分離根據表面吸附的原理，利用通氣鼓泡在液相中形成的氣泡為載體對液相中的溶質或顆粒進行分離，因此又稱泡沫吸附分離。其原理是向被處理水體中通入空氣，使水中的表面活性物質被微小氣泡吸著，并隨氣泡一起上浮到水面形成泡沫，然后分離水面泡沫，從而達到去除廢水中溶解態和懸浮態污染物的目的。由于泡沫分離技術不僅可以將蛋白質等有機物在未被礦化成氨化物和其他有毒物質前就已被去除，避免了有毒物質在水體中積累，而且可向養殖水體提供所必需的溶解氧，對維護養殖水體生態環境有良好作用。

泡沫分離是根據吸附的原理，向含表面活性物質的液體中鼓泡，使液體內的表面活性物質聚集在氣液界面（氣泡的表面）上，在液體主體上方形成泡沫層，將泡沫層和液相主體分開，就可以達到濃縮表面活性物質（在泡沫層）和凈化液相主體的目的。被濃縮的物質可以是表面活性物質，也可以是能與表面活性物質相絡合的物質，但它們必須具備和某一類型的表面活性物質能夠絡合或鰲合的能力。

2　化學處理法
1）臭氧處理法
海水工廠化養殖廢水存在養殖生物排泄物等懸浮物，以及氨氮、可生物降解有機物等物質，而且也存在難生物降解有機物。因此，利用臭氧、過氧化氫、二氧化氯、漂白液等化學氧化劑的氧化作用，氧化分解難生物降解溶解態有機物是養殖廢水深度處理的主要手段。因此采用O3/UV工藝，既能提高處理效率又可減少臭氧的用量。用O3/UV技術凈化湖水可達到水質凈化及水體增氧的目的。

臭氧的凈化原理在于它在水中的氧化還原電位為2.07 V，高于氯(1.36 V)和二氧化氯(1.5 V)。它能夠破壞和分解細胞的細胞壁(膜)，迅速擴散滲入細胞內，從而殺死病原菌。臭氧在水中分解的中間物質羥基自由基(•OH)，具有很強的氧化性，可以分解一般氧化劑難分解的有機物。因此，用臭氧處理廢水，既能夠迅速滅除細菌、病毒和氨等有害物質，又能增加水中溶解氧，從而達到凈化養殖廢水的目的。