(1)混合液溶解氧含量正常，活性污泥生長、凈化功能強時，出現的原生動物主要是固著型的纖毛蟲，如鐘蟲屬、累枝蟲屬、蓋蟲屬、聚縮蟲屬等，一般以鐘蟲屬居多。這類纖毛蟲以體柄分泌的粘液固著在污泥絮體上，它們的出現說明污泥凝聚沉淀性能較好。此時，若進水負荷較低，出水水質肯定良好，而且還會在鏡檢時發現輪蟲等以細菌為食的后生動物
(2)在曝氣池啟動階段，即活性污泥培養的初期，活性污泥的菌膠團性能和狀態尚未良好形成的時候，有機負荷率相對較高而DO含量較低，此時混合液中存在大量游離細菌，也就會出現大量的游泳型的纖毛蟲類原生動物，比如豆形蟲、腎形蟲、草履蟲等。
(3)混合液溶解氧不足時，可能出現的原生動物較少，主要是適應缺氧環境的扭頭蟲。這是一種體形較大的纖毛蟲，體長40～300μm，主要以細菌為食，適應中等污染程度的水域。因此鏡檢時一旦發現原生動物以扭頭蟲居多，說明曝氣池內已出現厭氧反應，需要及時降低進水負荷和加大曝氣量等有效措施。
(4)混合液曝氣過度或采用延時曝氣工藝時，活性污泥因氧化過度使其凝聚沉降性能變差，呈細分散狀，各種變形蟲和輪蟲會成為優勢菌種。
(5)活性污泥分散解體時，出水變得很渾濁，這時候出現的原生動物主要是小變形蟲，如輻射變形蟲等。這些原生動物體形微小、構造簡單，以細菌為食、行動遲緩。如果發現有大量這樣的原生動物出現，就應當立即減少回流污泥量和曝氣量。
(6)進水濃度低時，會出現大量的游仆蟲屬、鞍甲輪蟲屬、異尾輪蟲屬等原生動物。
(7)原生動物對外界環境的變化影響的敏感性高于細菌，沖擊負荷和有毒物質進入時，作為活性污泥中敏感性高的原生動物，盾纖蟲的數量就會急劇減少。
(8)活性污泥性能不好時，會出現鞭毛蟲類原生動物，一般只有波豆蟲屬和屋滴蟲屬出現，當活性污泥狀態端惡化時，原生動物和后生動物都會消失。
(9)在活性污泥狀況逐漸恢復時，會出現漫游蟲屬、斜管蟲屬、尖毛蟲屬等緩慢游動或匍匐前進的原生動物，和曝氣池啟動階段的原生動物種類相似。
