由于與化石燃料特性不同，生物質燃料的燃料機理、反應速度及燃料產物成分與化石燃料的相比都有較大的差別。生物質燃料的燃燒過程主要分為揮發份的析出，燃燒和殘余焦炭的燃燒、燃盡兩個獨立階段。其燃燒過程的特點：
① 水分含量多，燃料需要較高的干燥溫度和較長的干燥時間，產生的煙氣體積較大，排煙損失較高。
② 燃料的密度小，結構松散，迎風面積大，易吹起，懸浮段燃燒份額較大。
③ 發熱量低，灰熔點低，爐內溫度水平低，組織穩定的燃燒比較困難。
④ 由于揮發份高，燃料著火溫度較低，一般在250—350℃溫度下揮發份便大量析出并開始劇烈燃燒，此時若空氣量不足，會增大化學不*燃燒損失。
⑤ 會犯分析出燃盡后，受到灰燼包裹和空氣滲透困難的影響，焦炭顆粒燃盡困難，燃燒過度緩慢，如不采取適當的必要措施，將會導致灰燼中殘留較多的余碳，增大機械不*燃燒損失。
⑥ 秸稈等部分生物質燃料含氯量較高，因此需要對床層部分結構和運行工況加以特殊考慮，防止其對床層部分的腐蝕。
由此可見，生物質燃燒設備的設計和運行方式的選擇應從不同種類生物質燃料特性出發才能保證生物質燃料設備運行的經濟性和可靠性，提高生物質開發利用的效率。