一、排放的差異
由于層燃、室燃、循環流化床鍋爐的燃燒方式不同、爐膛結構不同，其原始NOx排放也有較大差異，一般來說，在未特意采用爐內低氮燃燒技術時，循環流化床NOx原始排放低，以鏈條爐為代表的層燃爐NOx原始排放也略低，煤粉工業鍋爐為室燃鍋爐，NOx原始排放越高，國內的低氮鍋爐排放卻大大降低。
二、鍋爐技術不同
層燃、室燃、循環流化床鍋爐可根據燃燒方式的不同采用不同的低氮燃燒技術，針對層燃鍋爐配風較常采用空氣分級以及煙氣再循環來實現低氮燃燒;在煙氣再循環對層燃鍋爐典型區段燃燒的影響下，結合空氣分級技術通過半焦催化還原NOx;爐內超級還原脫硝技術是近年來新興的爐內脫硝技術手段，通過在燃燒火焰區域的合理位置噴氨，實現在高溫火焰中直接脫硝。低氮鍋爐主要對二次風口、給煤口的位置及分布進行優化調整，或是增加煙氣再循環系統等。
三、安全性不同
中心在對層燃、室燃、循環流化床鍋爐的爐內低氮燃燒技術進行了大量試驗后，已在工程應用上加以驗證，總體來說低氮鍋爐，安全性要更高一些，之所以近年來它的銷量越來越高，有眾多用戶是因為它的安全性高，對空間環境的威脅小而購買，這也是它與普通鍋爐的重要差異之一。
