非編碼小分子RNA可以預測出某個人是否患有乳腺癌，致力于癌癥基因組圖譜計劃的研究人員得出這一結(jié)論。這一結(jié)果發(fā)表在《EMBO Reports》，指出特定類型的非編碼RNA水平的差異可以用來區(qū)別癌和非癌組織。這些RNA也可用于把癌癥患者分成具有不同的生存結(jié)果的亞群。
        小非編碼RNA是不產(chǎn)生蛋白質(zhì)的RNA分子，但在細胞中也有其它重要的功能。“多年來，由于其明顯的混沌分布以及無法將這些分子與已知功能或疾病相關聯(lián)，轉(zhuǎn)錄起始位點附近的非編碼小分子RNA被視為‘轉(zhuǎn)錄噪音’”加拿大西蒙弗雷澤大學和不列顛哥倫比亞大學教授，加拿大卑詩省癌癥研究中心杰出的科學家，該研究的牽頭作者Steven Jones說。“通過使用計算方法來分析我們生成的小RNA序列信息（癌癥基因組圖譜計劃的一部分），我們已經(jīng)能夠通過過濾這個“轉(zhuǎn)錄噪音”，發(fā)現(xiàn)臨床上有用的信息，”Jones補充說。“我們的實驗數(shù)據(jù)表明，蛋白質(zhì)編碼基因的*個外顯子的小非編碼RNA在表達水平中的全基因組變化與乳腺癌相關。”
        科學家們能夠區(qū)分健康人和乳腺癌患者的基因轉(zhuǎn)錄起始位點附近的眾多不同的小非編碼RNA。他們確定這些RNA分子在DNA序列的特定位置，并尋找被強烈表達的非編碼RNA與乳腺癌患者的相關性。然后，研究人員測試在基因組位置上表達的小RNA，是否可以用來從另一組已知具有乳腺癌的患者組織樣本中預測疾病。“預測癌癥的可能性被限制在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點附近發(fā)現(xiàn)的，許多小的、非編碼RNA的一個子集。更重要的是，這些RNA位點高度富集CpG島，”研究報告的*作者Athanasios Zovoilis說。 CpG島是含有胞嘧啶和*的高頻基因組區(qū)域。這些島出現(xiàn)RNA，表明他們可能參與DNA甲基化過程和疾病的發(fā)作，但需要額外的探索實驗來證明此關系。
        “這是*次發(fā)現(xiàn)基因的轉(zhuǎn)錄起始位點附近的非編碼小分子RNA與疾病有關，”Jones說。“盡管需要更深入的研究，但根據(jù)我們的數(shù)據(jù)，相信這些小的非編碼RNA有相當大的潛力作為預測工具用于癌癥的診斷。此外，它們還可以幫助我們在表觀遺傳水平更好地了解底層腫瘤的發(fā)生機制，然后采用非編碼小分子RNA作為潛在的新藥物。“研究人員還注意到，這類小的非編碼RNA可能對預測其他類型的癌癥或疾病有用。
        由癌癥基因組圖譜項目產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，為病變組織和正常組織提供了大量的可訪問測序信息，使本工作成為可能。現(xiàn)在，癌癥基因組圖譜是現(xiàn)存的非編碼小分子RNA的zui大資源之一。