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同濟大學Nature子刊揭示驅動蛋白作用機制

時間:2013-7-30閱讀:405
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生物通報道:來自同濟大學生命科學與技術學院,法國國家科研中心LEBS實驗室的研究人員發表了題為“Structure of a kinesin–tubulin complex and implications for kinesin motility”的文章,闡明了驅動蛋白與微管蛋白的相互作用方式和結合位點,揭示了驅動蛋白發生ATP水解時的構象。這一研究成果公布在Nature Structural & Molecular Biology雜志上。文章的通訊作者是同濟大學蛋白質研究所王春光教授,以及法國國家科研中心LEBS實驗室Marcel Knossow博士,其中驅動蛋白與微管蛋白相互作用的生化性質研究由同濟大學博士生王偉毅和本科生姜啟陽完成。
驅動蛋白(kinesin)是一大類以微管(microtubule)為軌道的馬達蛋白,能夠把水解ATP產生的能量轉化為機械能,負責很多物質的胞內運輸,因此參與許多重要的生物學活動。驅動蛋白在微管上的運輸工作高度嚴格有效,每一個ATP水解事件都能使得驅動蛋白在微管上向前邁一步。在這一過程中,ATP與驅動蛋白的結合是一個關鍵步驟,足以使得驅動蛋白產生power stroke。但驅動蛋白工作過程的結構機制從未在原子分辨率水平得到解析。在這篇文章中,研究人員通過解析ATP結合狀態下驅動蛋白與微管蛋白(tubulin)的復合物晶體結構,闡明了驅動蛋白與微管蛋白的相互作用方式和結合位點,揭示了驅動蛋白發生ATP水解時的構象。更重要的是,從該復合物晶體結構中可以清楚地看到,驅動蛋白與ATP的結合和與微管蛋白的結合分別導致其馬達結構域中兩個α-螺旋H6和H4的位移,這又使得驅動蛋白的Neck linker片段結合到馬達結構域表面,形成docking的構象,這就是驅動蛋白工作過程中產生作用力的關鍵構象變化。這一結果大大促進了對驅動蛋白工作機理的理解,并為進一步的研究奠定了基礎。
此外同在這本雜志上,近期同濟大學與Dana-Farber癌癥研究所的研究人員合作,利用整合基因組數據分析方法,挖掘臨床相關的癌癥重要長非編碼RNA,找到了兩個重要的前列腺癌lncRNA基因。研究人員通過對公共數據庫中人類外顯子芯片(Human Exon Array)的重注釋和再分析,對lncRNA在癌癥中的表達譜進行研究,并結合其它類型的數據,挖掘出在癌癥中起作用的lncRNA和可能被用于癌癥診斷的生物標簽。他們結合各種組學數據,著重對前列腺癌進行了分析,找到了兩個重要的lncRNA基因(分別命名為PCAN-R1和PCAN-R2),并通過實驗手段驗證了這兩個lncRNA確實在前列腺癌中起到了調控癌細胞生長的作用。

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