zui近由于RNA干擾(RNA interference,RNAi)的發(fā)現(xiàn)使反義領(lǐng)域的研究增多。這種自然發(fā)生的現(xiàn)象zui早是在秀麗線蟲中發(fā)現(xiàn)的(1),是序列特異性地使轉(zhuǎn)錄后的基因沉默的有力機(jī)制。由于zui近兩年在RNAi領(lǐng)域取得的進(jìn)步,已經(jīng)有許多這方面的綜述發(fā)表(2-4)。RNA干擾是由長(zhǎng)的雙鏈RNA分子發(fā)動(dòng)的,該分子可以被Dicer enzyme加工成長(zhǎng)度為21-23個(gè)核苷酸的RNA(見(jiàn)圖)。RNaseIII蛋白被認(rèn)為是作為一個(gè)二聚體發(fā)揮作用,它對(duì)雙鏈RNA的兩個(gè)鏈都進(jìn)行切割,酶切的產(chǎn)物3’末端互相重疊。然后這種小的干擾RNA分子(small interfering RNAs,siRNAs)摻入RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RNA-induced silencing complex,RISC),引導(dǎo)核酸酶降解靶RNA。
這種保守的生化機(jī)制可用于研究多種模式生物的基因功能,但是它在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的應(yīng)用受到阻礙,因?yàn)殚L(zhǎng)的雙鏈RNA分子會(huì)引起干擾素應(yīng)答。因此Tuschi及其同事表明長(zhǎng)度為21nt的siRNA可以特異性的抑制哺乳動(dòng)物細(xì)胞基因表達(dá)是一個(gè)革命性的突破(5)。這個(gè)發(fā)現(xiàn)激發(fā)了大量利用rnai技術(shù)對(duì)哺乳動(dòng)物細(xì)胞的研究,因?yàn)榕c傳統(tǒng)的反義技術(shù)比,RNAi的性能明顯較高。 反義技術(shù)——RNA干擾(RNA interference,RNAi)
有趣的是,除了短雙鏈RNA,短發(fā)夾RNA(small nuclear RNA,snRNA)比如莖環(huán)結(jié)構(gòu)在細(xì)胞內(nèi)經(jīng)過(guò)加工后也可以變成siRNA,從而產(chǎn)生RNA干擾(6、7)。這使得構(gòu)建表達(dá)干擾RNA的載體,從而使哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)沉默成為可能(4、8)。shRNA可以利用RNA聚核酶III啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄,在正常情況下,該啟動(dòng)子是控制小核RNA(small nuclear RNA,snRNA)U6(6、7、9、10)或者RNaseP的組分H1 RNA(11)轉(zhuǎn)錄的。另外一種辦法是兩段短RNA分子分別用U6啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄出來(lái)(6、12、13)。載體介導(dǎo)的siRNA表達(dá)使對(duì)功能缺失(loss-of-function)表型進(jìn)行分析成為可能。在穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的細(xì)胞內(nèi),兩個(gè)月后仍可觀察到沉默現(xiàn)象(11)。
另外一種延長(zhǎng)sirna抑制基因表達(dá)時(shí)間的方法是對(duì)化學(xué)合成的RNA進(jìn)行核苷酸修飾。盡管未經(jīng)修飾的短雙鏈RNA在細(xì)胞培養(yǎng)物或者體內(nèi)的穩(wěn)定性出乎意料的高,然而有些情況下,需要對(duì)siRNA的穩(wěn)定性進(jìn)行進(jìn)一步提高。因此,可以在兩條鏈的末端都引入經(jīng)過(guò)修飾的核苷(14)。一個(gè)5’端為兩個(gè)2’-O-甲基RNA、3’端為4個(gè)甲基化核苷的siRNA與序列相同但是未經(jīng)修飾的siRNA比活性相同,但是在細(xì)胞培養(yǎng)物中引起的基因沉默現(xiàn)象的時(shí)間延長(zhǎng)。然而,增多siRNA中的甲基化核苷,或者在核苷中引入體積較大的烯丙基將導(dǎo)致siRNA活性下降。
RNA干擾在哺乳動(dòng)物體內(nèi)的*個(gè)研究是利用快速注射大量生理溶液的方法將一個(gè)編碼shrna的質(zhì)粒注入老鼠的尾靜脈(15、16)。在大多數(shù)器官中,報(bào)道基因(編碼于共轉(zhuǎn)染質(zhì)粒或者轉(zhuǎn)基因小鼠上)的表達(dá)可以被有效地抑制。另外,F(xiàn)as基因被作為肝損傷治療相關(guān)的內(nèi)源靶標(biāo)進(jìn)行了RNA干擾實(shí)驗(yàn)(17)。注射siRNA之后,小鼠肝細(xì)胞中的Fas mRNA和蛋白水平下降了10天。把Fas基因沉默可以保護(hù)小鼠免遭由注射競(jìng)爭(zhēng)性Fas特異抗體引起的爆發(fā)性肝炎,82%用siRNA處理的小鼠活過(guò)了10天觀察期,而所有的對(duì)照小鼠在3天之內(nèi)死亡。
上述研究中采用的高壓導(dǎo)入技術(shù)是一種粗暴的方法,不適于治療用。因此,標(biāo)準(zhǔn)的基因治療所采用的方法被用于RNA干擾。一個(gè)反轉(zhuǎn)錄病毒載體被用于導(dǎo)入siRNA,以抑制人類胰腺腫瘤細(xì)胞中的癌基因K-ras等位基因(18)。負(fù)調(diào)控癌細(xì)胞中K-ras基因的表達(dá)使得它們?cè)谧⑷霟o(wú)胸腺的裸鼠皮下之后不再具有形成腫瘤的能力。這項(xiàng)研究還表明siRNA的高度特異性,因?yàn)橹挥邪┗騅-ras被沉默,而與之只有1個(gè)堿基對(duì)差異的野生型等位基因并沒(méi)有被沉默。另外,當(dāng)在紋狀區(qū)注射表達(dá)siRNA的腺病毒之后,轉(zhuǎn)基因小鼠大腦中GFP基因的表達(dá)可以被抑制(19)。β-葡萄糖醛酸苷酶(b-glucoronidase)的活性可以通過(guò)在小鼠尾靜脈注射重組腺病毒抑制。有趣的是,具有CMV啟動(dòng)子和zui小的polyA尾的RNA聚合酶II表達(dá)元件被用于這個(gè)實(shí)驗(yàn),為設(shè)計(jì)組織特異性或者可誘導(dǎo)的siRNA載體打開(kāi)了大門。
總的來(lái)說(shuō),siRNA的*個(gè)體內(nèi)實(shí)驗(yàn)已經(jīng)進(jìn)行,其他有重要意義的基因有望于很快作為靶標(biāo)開(kāi)展研究。至今為止的研究沒(méi)有觀察到任何應(yīng)用siRNA引起的毒性作用,但是在治療人類疾病的臨床試驗(yàn)開(kāi)始之前仍需小心,以排除使用RNA干擾引起的嚴(yán)重副作用。因?yàn)橛胹iRNA使基因表達(dá)沉默與傳統(tǒng)的反義技術(shù)相似,研究者將從十多年來(lái)反義技術(shù)研究的教訓(xùn)中獲益,比如需要使用合適的對(duì)照以證明基因表達(dá)的敲除是特異性的,以及對(duì)免疫系統(tǒng)可能引起的意外影響進(jìn)行詳細(xì)分析。
總結(jié)
經(jīng)過(guò)盛衰沉浮,反義技術(shù)近年來(lái)得到越來(lái)越多的注意。對(duì)能夠提高靶表親和性和生物穩(wěn)定性、降低毒性的修飾核苷的研究取得了重要進(jìn)展。由于大多數(shù)新的DNA類似物不能激活RNaseH,對(duì)反義寡核苷酸的設(shè)計(jì)需要考慮靶mRNA是否需要保留,例如,是改變剪接方式,還是降解靶mRNA(這種情況下應(yīng)該使用gapmer技術(shù))。可以通過(guò)有系統(tǒng)的修飾天然核酶或者通過(guò)體外選擇技術(shù)獲得具有高催化活性的穩(wěn)定核酶。一些反義寡核苷酸和核酶已經(jīng)進(jìn)入臨床試驗(yàn)研究,一個(gè)反義藥物已經(jīng)在1998年獲得批準(zhǔn)。一個(gè)重要的突破是發(fā)現(xiàn)短的雙鏈RNA分子可用于哺乳動(dòng)物細(xì)胞中特異性沉默基因表達(dá)。這個(gè)方法與傳統(tǒng)的反義技術(shù)比效率明顯更高,并且一些體內(nèi)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)已經(jīng)發(fā)表。因此,反義技術(shù)有望廣泛應(yīng)用于對(duì)未知功能基因的研究、藥物靶標(biāo)的確認(rèn)和治療。