蛋白在蔗糖梯度中的沉降率可以用于與已經(jīng)知道的S值與其在同梯度中蛋白相比來確定其S值。從而可用于計(jì)算蛋白的大約的分子量,也可用于鑒定兩個(gè)蛋白的相互作用,如果他們在相同梯度出峰。
一、材料和試劑
1. 蔗糖(SigmaCatalog No.S0389)
2. 明膠(SigmaCatalog No.G9136)
二、儀器
1.離心機(jī)(BeckmanFalcon,TLS-55)
2.梯度混合器(Sigma)
三、步驟
1. 用與蛋白樣品緩沖液相同的緩沖液制作10%和40%的蔗糖溶液。
2. 用的1%明膠包被管子,用1%的明膠溶液加滿管子,倒出凝膠溶液并用ddH2O洗滌。
3. 制作10-40%蔗糖梯度
注意:梯度混合器有兩個(gè)室,儲存室和混合室,并用一個(gè)不互聯(lián)的膜隔開。用另一個(gè)膜來調(diào)控從混合器中流出。在混合室中的磁力攪拌器可以幫助保持一個(gè)不變的梯度所有的混合器都有一個(gè)平面用于放在磁力攪拌器上。
4. 將梯度混合器放在磁力攪拌器上面,使其水平。將一個(gè)小的攪拌子放入混合室中。
5. 使所有瓣膜關(guān)閉,用1/2想要的梯度量加入每個(gè)室中,用40%在混合室,10%蔗糖在儲存室。
6. 打開磁力攪拌器使得它輕輕的攪拌。
7. 將輸出管放到一個(gè)離心管中,使起剛剛碰到接近頂部的邊。
8. 同時(shí)打開兩個(gè)膜,40%蔗糖溶液開始進(jìn)入離心管,10%蔗糖開始與40%蔗糖混合。當(dāng)梯度接近離心管的頂部關(guān)閉兩個(gè)瓣膜。確定有足夠的地方放頂部的梯度樣品。
9. 把梯度的轉(zhuǎn)子放在冷室中2~48 hrs,確定管子平衡并且樣品在頂部,樣品只占很少的體積(如100 μl 對于2.2 ml 梯度溶液)。
10. 55 000 rpm 離心2.5小時(shí)。
11. 收集組分并且用Western blotting 檢測。醛縮酶(158 kD,7S)和甲狀腺球蛋白(690 kD,19S)(Bio-RadLaboratories)并用于marker被用于一起檢測。
四、配置方法
1. 10%蔗糖溶液:10 mg 蔗糖溶于100 ml ddH2O
2. 40%蔗糖溶液:40 mg 蔗糖溶于100 ml ddH2O