1.概 述
mRNA差異顯示技術(mRNA differetial display)是一種快速有效的克隆差異性表達基因的方法。
方法建立:1992年 Liang P和Pardee應用DD技術對比人類乳腺癌細胞與正常細胞所表達的mRNA,以此來克隆癌細胞所*的基因
目前已應用于個各領域:
農業、植物
動物
醫學
? 胚胎發育
? 遺傳病
? 藥物
? 腫瘤
2.mRNA差異顯示原理
是分離差異表達基因的一個重要方法。人類大約含有三萬個不同的基因。在不同的單個細胞中只有10%的基因處于表達狀態。
生物體在不同的生理,病理狀態下,基因的表達水平不同。
生命過程中選擇性表達的基因主要有:發育與分化、體內平衡、對攻擊的應答、細胞周期調節、老化和程序性細胞死亡等。
差異顯示獲得的只是某個基因的片段,而不是直接獲得全長cDNA克隆。
3.基本程序
選擇表型特性差異顯著對象
展示mRNA的差異
基因差異
克隆與表型差異高度相關的新基因
4.技術
? 基本技術
逆轉錄( RT )
聚合酶鏈反應(PCR)
凝膠電泳
5.RT-PCR
? 錨定引物 T12-MN,含有12個T可以結合于mRNA 3`端 poly(A)尾,M為A、C、G 3種堿基之一,N為A、T、C、G 4種堿基之一。
? 熒光錨定引物 ,引物5`端加入T7 RNA多聚酶啟動子并帶有熒光分子
----------- AAAAAAAAAA –3` mRNA
------------XAAAAAAAAAAA–3` 1/3 mRNA
MTTTTTTTTTTTT(12T) Prime
---------YXAAAAAAAAAAAAA –3` 1/12 mRNA
NMTTTTTTTTTTTT(12T)Anchor Prime
?熒光錨定引物:
NMTTTTTTTTTTTT-T7 RNA多聚酶啟動子-熒光分子
(Genomyx company)
因此共有12種錨定引物
?同位素標記錨定引物
?隨機引物 (Arbitrary Prime)
可以隨機地與cDNA不同位置多個位點結合,擴增出不同長度的cDNA片段混合物。
共20種隨機引物,隨機引物-M13
?隨機和錨定引物的多種組合可以展示10000-15000種mRNA