自身抗原
抗骨骼肌抗體的靶抗原包括肌動蛋白、α—輔助肌動蛋白、肌球蛋白和ryanodine受體（肌漿網鈣離子釋放通道蛋白，通過鈣的快速釋放和重攝取調節肌肉的收縮和松弛）。多克隆和單克隆抗體均可識別骨骼肌和胸腺上皮細胞的共同表位。也有乙酰*（AchR）α亞基的抗原表位。
自身抗體
1．同義詞 抗橫紋肌抗體。
2．致病作用 抗骨骼肌抗體能夠與胸腺髓質和上皮細胞結合，提示胸腺組織中存在骨骼肌成分或存在交叉抗原，同時也說明胸腺在骨骼肌抗體產生過程中可能發揮重要的作用。在原發性MG患者中檢出的抗骨骼肌抗體通常為IgG型，而在經D青霉氨治療的風濕性關節炎患者中，骨骼肌抗體主要為IgM。伴胸腺瘤MG患者中ryanodine受體抗體多為IgGl和（或）IgG3亞群，少數為IgG2、IgG4、IgA或IgM。
目前對于胸腺瘤與MG相關性存在以下幾種假說：①易患MG及叵倭穌呔哂泄餐囊糯畢藎虎諦叵倭齟覯G相關性胸腺增生逐漸發展而來；③存在針對腫瘤相關抗原的副癌性自身免疫應答；④胸腺瘤缺少陰性T細胞選擇或假陽性T細胞選擇或自身敏感性。
伴胸腺瘤的MG患者胸腺中均存在CDl陽性未成熟胸腺細胞，該細胞參與陽性T細胞選擇過程。表明與AchR相關的免疫原性肽段可能存在于胸腺瘤上皮細胞中。采用限制性片段長度多肽分析（RFPL）顯示，胸腺瘤上皮細胞的AChR亞單位基因與正常組織上的相同，但采用敏感的電生理技術檢測AchR功能時發現前者無功能。AChRa亞單位上373—380位殘基片段的單克隆抗體鑒定，證明在正常和胸腺瘤的胸腺髓質上皮細胞中均存在VICE-a（AchRa亞基的胞質段抗原表位）。VICE-a表達與MG之臨床相關性。
以AChRa亞單位上第371—380位殘基肽的寡核苷酸探針采用RFLP技術和以胸腺瘤提取物為抗原進行蛋白質印跡（免疫印跡）分析顯示胸腺瘤組織中存在含有VICE-a的非AchR蛋白，提示VICEa表位是MG相關的胸腺瘤的特征，它在正常上皮細胞中低表達，但在MG相關的胸腺瘤皮質上皮細胞、特別是鄰近未成熟胸腺細胞的部位異常高表達。說明這些表位的異常表達有可能導致AchR特異性T細胞激活或假陽性AChR敏感性T細胞克隆選擇，從而在MG發病中起作用。

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