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在Boc固相法中反復使用酸處理會帶來一些問題,如使肽鍵斷裂和酸催化產生其他副反應等。Boc固相法尤其不適于合成含有*等對酸不穩定的肽類。1978年,Chang、Meienlofer和Atherton等采用Carpino報道的Fmoc基團作為氨基保護基,成功地合成了多肽。目前,Fmoc固相法已經得到廣泛的應用,并越來越受到人們的重視。與Boc法相比,Fmoc不同之處在于氨基保護基采用堿性可脫除的Fmoc基,側鏈保護基采用TFA可脫除的叔丁基。樹脂采用91%TFA可切斷的對烷氧芐醇型樹脂和l%TFA可切斷的二烷氧芐醇型樹脂,因此,脫保護避免了強酸處理,用TFA或TMSBr即可完成。
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