微生物試劑在養殖過程的使用 
1、要采用適當的方法及適時使用：有些微生物制劑可全池潑灑，有的作為飼料添加劑，有的可與其他物質混合使用，要選擇好投放時間。如光合細菌及硝化細菌投放時和沸石粉混合使用，不僅能將光合細菌迅速沉降到底部，還能起到吸附氨的作用。  
2、要盡早使用：通過先入菌的大量繁殖，形成優勢種群，減少或阻礙病原菌的定居。 
3、要長期使用：微生物制劑的預防效果好于治療效果，其作用發揮較慢，長期使用方能達到預期的效果。
4、有的微生物試劑在使用前要活化培養：活化能讓微生物迅速“復活”，活菌數量成倍增加，也能使菌迅速適應池塘水質條件。如芽孢桿菌使用前要采用本池水加上少量的紅糖或蜂蜜，浸泡4~5個小時后即可潑灑，這樣活化的芽孢桿菌繁殖速度快，提高使用效率。
5、施用時注意菌體活力及菌體數量：微生物制劑必須含有一定量的活菌，一般要求含3億個/ml以上的活菌體，且活力強，同時注意制劑的保存期，隨著保存期的延長，活菌數量逐漸減少，故保存期不宜過長，并且打開包裝后盡快使用。 
6、禁止與抗生素、消毒殺菌藥或具有抗菌作用的中草藥同時使用：如光合細菌作為活菌，藥物對它有殺滅作用，水體使用消毒劑五天后才可使用，使用抗生素兩天后才能使用。硝化細菌不可與化學增氧劑合用，如過氧化鈣等，這些物質在水中分解出氧化性較強的氧原子，會殺死硝化細菌，所以兩天后使用。 
7、注意一些不利因素的影響：溫度、PH值不適時會影響使用效果。如光合細菌使用時zui適水溫28-36℃，所以在水溫20℃以上時使用效果好，陰雨天勿用。硝化細菌在PH低于7或高于8.5的水體中繁殖速度會受到一定的影響，zui適范圍為7.8-8.2，所以控制好體中的PH值，有利于有益微生物的生長。