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腎透明細胞癌基因組學研究成果于《自然-遺傳學》雜志發(fā)表

時間:2011-12-6閱讀:854
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2011年12月5日,由華大基因、北京大學深圳醫(yī)院和深圳市第二人民醫(yī)院等單位合作完成的研究成果——《對腎透明細胞癌中泛素介導(dǎo)的蛋白降解通路的相關(guān)基因突變研究》(Frequent mutations of genes encoding ubiquitin-mediated proteolysis pathway components in clear cell renal cell carcinoma)在雜志《自然-遺傳學》(Nature Genetics)上在線發(fā)表。這是繼今年八月份在《自然-遺傳學》上發(fā)表的膀胱癌研究之后,該團隊取得的又一重要癌癥研究成果,為腎癌的發(fā)病機理研究以及診斷、治療奠定了堅實的科研基礎(chǔ)。

腎癌是泌尿系統(tǒng)腫瘤中致死率zui高的一種,其發(fā)病率和死亡率約占全部腫瘤的2%。其中,腎透明細胞癌(clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是腎癌中zui常見、惡性程度zui高的一種亞型,每年*大約會有102,000例患者因此而死亡。

在本研究中,研究人員對10例ccRCCs患者的腫瘤組織和正常對照樣本進行了外顯子測序研究,并在88例ccRCCs患者中進行了驗證,鑒定出23個與ccRCCs相關(guān)的顯著突變基因,其中12個基因是在ccRCCs中被發(fā)現(xiàn)。

泛素介導(dǎo)的蛋白降解通路(Ubiquitin-Mediated Proteolysis Pathway, UMPP)是調(diào)節(jié)多種細胞生物學過程的重要機制,在正常細胞的蛋白質(zhì)降解中起著十分重要的作用。在本研究中,研究人員對所有的含有非同義突變的基因進行信號通路分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)UMPP相關(guān)基因突變頻率較高,約有50%的檢測樣本的UMPP相關(guān)基因發(fā)生了突變,包括VHL(27%), BAP1(8%), CUL7(3%), BTRC(2%)等。已有研究發(fā)現(xiàn),VHL基因(UMPP 通路成員之一)為抑癌基因,該基因的失活可導(dǎo)致兩個重要的缺氧誘導(dǎo)調(diào)節(jié)因子——HIF1α和HIF2α的累積,從而使腫瘤發(fā)展相關(guān)基因 (VEGF, PDGF等)表達增加,這與ccRCCs的發(fā)生發(fā)展有著密切的關(guān)系。研究人員推測,與UMPP相關(guān)的其他基因的異常,也可能會導(dǎo)致類似的結(jié)果。

為了證明該推測,研究人員對所有的ccRCCs患者樣本進行了免疫組化分析,發(fā)現(xiàn)UMPP通路異常和腫瘤組織中HIF1α、HIF2α的過量表達有著密切的關(guān)系。進一步研究發(fā)現(xiàn)UMPP 通路中除VHL基因之外的其他基因突變和腫瘤組織中HIF2α的過量表達確實具有明顯的正相關(guān)性,這表明非-VHL的UMPP基因在該過程中也可能發(fā)揮著重要的作用。

文章的*作者、華大基因該項目負責人郭廣武博士說:“通過此次研究,我們推測由UMPP相關(guān)基因突變而激活的缺氧調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)與ccRCCs的發(fā)生有著非常重要的關(guān)聯(lián),但是HIF1α和HIF2α只是UMPP調(diào)控的整個蛋白網(wǎng)絡(luò)的一員,今后我們會對ccRCC的蛋白質(zhì)組進行研究,進一步探索UMPP在腎癌發(fā)生、發(fā)展中的作用。”

來源:華大基因

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