醫藥凈化工程設備由于有不同的檔次要求，潔凈室的制作依據百級、萬級、十萬級等對應不同的制作標準。一般來說，為了達到清潔水平，主要通過技術安頓、建筑平面、建筑結構和裝飾、空氣清潔方法、人員和材料清潔、保護處理等途徑完成。
凈化工廠潔凈室在手術時對環境的要求非常嚴格，為了保障凈化工廠潔凈室手術的正常進行，為了不讓患者感染病原菌，手術室的人應該嚴格控制。
醫藥凈化工程設備在規劃裝修時需要注意哪些關鍵點，醫院手術室凈化工程或者醫療潔凈室，對空氣潔凈度要求比較高。特殊的建筑區域，如隔離室、特定的測試和護理區域，也需要用高效的過濾器過濾空氣。
手術室的上部一般選擇高效的空氣過濾系統，復蓋面積達到3x3m以上，醫院清潔手術室的數量一般按住院總床數的2%確認，也許外科病房總床數的4%確認。一般縣醫院的清潔室是清潔度(萬級)，不要盲目增設手術室。
醫藥凈化工程設備醫藥廠房潔凈室關鍵技術主要在于控制塵埃和微生物，作為污染物質，微生物是醫藥廠房潔凈室環境控制的重中之重。GMP需要空氣凈化技術，而空氣凈化技術不代表GMP！潔凈度等級不適用于表征懸浮粒子的物理性、化學性、放射性和生命性。不熟悉藥品生產工藝和過程，不了解造成污染的原因和污染物質積聚的場所，不掌握清除污染物質的方法和評價標準，以為潔凈度滿足要求的潔凈室就能生產出高質量藥品是GMP認識上的一大誤區。
GMP技術改造醫藥廠房凈化工程普遍存在以下兩種情況：
（一）正由于存在主觀認識上的誤區，在污染控制過程中的潔凈技術應用不利，最終出現了有的藥廠投入巨資改造后，藥品質量并未明顯提高。
醫藥潔凈生產廠房的設計、施工、廠房內設備設施的制造、安裝，生產用原輔物料、包裝材料質量、人凈物凈設施控制程序執行不利等都會影響產品質量。
凈化工程施工方面影響產品質量的原因是過程控制環節有問題，在安裝施工過程中留有隱患，有如下具體表現：
①凈化空調系統風道內壁不干凈、連接不嚴密、漏風率過大；②彩鋼板圍護結構不嚴密，潔凈室與技術夾層（吊頂）的密封措施不當、密閉門不密閉；③裝飾型材及工藝管線在潔凈室形成了死角、積塵；④個別位置未按照設計要求施工，無法滿足相關要求規定；⑤所用密封膠質量不過關、易脫落、變質；⑥回、排風彩鋼板夾道相通，粉塵從排風到進入回風道；⑦工藝純化水、注射水等不銹鋼衛生管道焊接時內壁焊縫未成型；⑧風道止回閥動作失靈，空氣倒灌造成污染；⑨排水系統安裝質量不過關、管架、附件易積塵；⑩潔凈室壓差整定不合格，未能滿足生產工藝要求。
所以，針對每個專業安裝工程公司，潔凈室凈化工程施工無論潔凈度的高還是低，都必須為藥廠作好工程部分對污染源進入前的過程控制。
（二）大多數藥廠潔凈室節能效果差，形成不必要的支出，加大了藥品的生產成本。
比如有些藥廠凈化車間在空態或靜態測試潔凈度時，勉強合格，在動態測試（生產）條件下，潔凈度不理想；所以不得不把空調機組變頻調速設置為Max工況（如此換氣次數即達到相對值），以使室內潔凈度達到要求。換氣次數的增加勢必會導致能耗加大，形成不必要的支出，加大了藥品的生產成本。
有的藥廠投資人為節約初投資而擅自降低設計要求的條件，購置價格相對低廉的設備如冷水機組、水泵、風機和藥機，這些看似便宜的設備效率低，悄悄的把能量白白消耗掉，使投資人得不償失。
