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束倫(上海)技術服務有限公司


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高通量基因測序儀

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產品型號*/RS II

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更新時間:2022-09-08 18:59:45瀏覽次數:189次

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產品簡介

性能指標測序讀長:平均讀長3-12Kb,最長可達30Kb

詳細介紹

性能指標

  1. 測序讀長:平均讀長 3-12 Kb,最長可達30Kb;
  2. 一致性準確率:一致性準確率可達 99.99%;
  3. GC含量檢測能力:無需PCR擴增,適合GC含量基因組;
  4. 堿基修飾:可直接讀取,并可以檢測未知堿基修飾及DNA損傷類型;
  5. 有效數據產量/Cell:0.5-1.2G/Cell;
  6. 輸出數據格式和數據兼容性:數據格式和二代兼容;
  7. 軟件:smrt analysis提供二級數據分析。

主要應用

  1. 未知物種全基因組從頭測序;
  2. 已測序物種的基因組重新測序;
  3. 特定目標區域深度測序;
  4. 微生物多樣性分析(全長16S rRNA 測序);
  5. 無需拼接的轉錄組測序;
  6. 甲基化修飾等表觀遺傳學研究;
  7. 多重PCR擴增片段測序。

樣品要求

1.基因組或PCR產物:

  • 雙鏈DNA,未曾反復凍融,未曾暴露在高溫環境(>65C)和PH環境(< 6或> 9);
  • 未經熒光染色或紫外照射(避免EB染色);
  • 不包含變性劑(如guanidinium salts 或 phenol)和洗滌劑(如SDS或Triton-X100);
  • 不包含不溶解的物質;
  • 不包含蛋白、RNA、糖類等污染;
  • 不包含來自原始樣本的污染物(如heme, humic acid, polypheno等);
  • OD260/OD280范圍在1.8 - 2.0,OD260/OD230 約為2.0;

2.基因組DNA總量>5ug,濃度>50ng/ul;PCR產物總量>500ng;

3.制備好的文庫:2100檢測圖譜和Qubit濃度定量結果;

4.損傷較嚴重樣品需提前說明,并與儀器操作人員聯系;

5.病毒、致病微生物等危險性樣本恕不接收。

儀器說明

PacBio RS II測序系統,是基于單分子實時(Single Molecule Real Time, SMRT)DNA測序技術和納米微孔應用的第三代測序平臺。它能帶來測序行業的一致準確性和最長的讀長,讓科學家能夠快速經濟地完成基因組組裝,揭示并了解表觀基因組,以及鑒定基因組變異,是基因組從頭測序和全長轉錄組測序的。上海交通大學2015年引進了華東地區第二臺PacBio RS II第三代測序儀,力爭提供更全面的基因組測序服務,助力基因組學研究。該儀器由分析測試中心生命科學室管理運行。

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