負壓病房也是WHO在規定搶救非典病人時特別強調的一個重要條件，但是國內的很多家醫院都難以達到這個水平。所謂負壓病房是指在特殊的裝置之下，病房內的氣壓低于病房外的氣壓，這樣的話，從空氣的流通來講，就只能是外面的新鮮空氣可以流進病房，病房內被患者污染過的空氣就不會泄露出去，而是通過專門的通道及時排放到固定的地方。做為燃煤發電廠鍋爐進風排風凈化可簡單些。這樣病房外的地方就不會被污染，從而減少了醫務人員被大量感染的機會，這種病房搶救類似非典這樣的呼吸道傳染性疾病病人。
傳染病負壓隔離病房的功能主要有兩點，一是利用負壓原理隔離病原微生物，同時將室內被患者污染的空氣經特殊處理后排放，不會污染環境；二是通過通風換氣及合理的氣流組織，稀釋病房內的病原微生物濃度，并使醫護人員處于有利的風向段，保護醫護人員工作安全。傳染病負壓隔離病房一般由病室、緩沖間、衛生間三部分組成。
傳染病負壓隔離病房使用一套送風凈化裝置，二套排風凈化裝置。送風凈化裝置由送風柜和粗效、中效、高效過濾裝置組成，過濾效率為99.99%。（粒經≥0.3μm）。排風凈化裝置排風柜和粗效、中效過濾裝置組成，過濾效率為99.99%（粒經≥0.3μm）。
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