水質檢測中心實驗室可分為：原子吸收室、原子熒光室、離子色譜室、離子色譜室、液相色譜室、高溫實驗室、微生物檢測室、放射室、更衣室，實驗室，綜合實驗室，藥品室等
（1）原子吸收室：原子吸收儀器應該放置在單獨的實驗室內(不與其它儀器混放)；儀器上方有良好的排風裝置，原子吸收儀器室不得放置有機試劑，實驗室應具備獨立的鋼瓶室，并具備相應的防爆設施，穩定的220V電源(220V±10%，無波動)，避免與大型用電設備使用同相電源，儀器室附近無震源，儀器室附近無強磁場，儀器室內安裝空調，控溫，除濕，儀器室應具備防異物進入措施(如防鼠等)
（2）原子熒光室：原子熒光儀安裝室至少應具有12平方米的面積，陽光不能直射儀器，不能有除水暖氣和空調外 的任何熱源，墻壁和頂棚是經油漆刷過，防止一般涂料引起的掉肩揚塵，無腐蝕性氣體、 通風良好，儀器室周圍不得有很大的用電設備及強震動的機械。環境溫度應為(15-30)°C， 且相對穩定，相對濕度不大于75%。
（3）離子色譜室:
①分析室的周圍不得有強磁場，易燃和強腐蝕性氣體。
②室內的環境溫度應在5~35度范圍內，濕度應小于等于85%(相對濕度)，且室內應保持空氣流暢，有條件的話能安裝空調。
③準備好能承受整套儀器，寬高適中，便于操作的工作平臺。一般工廠以水泥平臺較佳(高0.6~0.8米)，平臺不能緊靠墻，應離墻0.5~1.0米，便于接線及檢修用。
④供儀器使用的動力線路容量應在10KVA左右，而且儀器使用電源應盡可能不與大功率耗電量設備或經常大幅度變化的用電設備公用一條線。電源必須接地良好，一般在潮濕地面(或食鹽溶液灌注)釘入長約0.5~1.0米的鐵棒(絲)，然后將電源接地點與之相連，總之要求接地電阻小于1歐姆即可。
（4）液相色譜室： 主要體現在高效率分離，對復雜的有機化合物分離制取純凈化合物，定量分析和定性分析，儀器設備主要有：高效液相色譜儀，適宜于高沸點化合物、難揮發化合物、熱不穩定化合物、離子化合物、高聚物等，彌補氣相色譜儀的不足。環境和實驗室基礎裝備設計要求與氣相色諳室相近
（5）高溫實驗室：高低溫實驗室可以用來考核和確定電工、電子產品或材料在溫度循環變化，產品表面產生高溫或低溫環境條件下貯存和使用的適應性。廣泛應用于航空航天產品、信息電子儀器儀表、材料、電工、電子產品等行業中。
（6）微生物檢測室：微生物實驗室應設置成獨立的區域，與其他實驗室分開，門口設有門禁，非相關人員不得進入，各室根據工作內容合理布局，既方便工作又不互相影響。入口處設置集中式更間，培養室根據培養條件和種類不同可設置多間(如霉菌培養室、細菌培養室、固體培養室、液體培養室等)。
①潔凈實驗室：自成一區，安排在實驗室的靠邊角落處，用密封門限制人員的進出，把有潔凈要求的房間設置在人員干擾較少的地方，把輔助房間設置在外部。考慮微生物實驗操作流程，方便人流與物流的份額里。為控制人員的出入(人流)，只設有一個密封門進入微生物實驗室主潔凈區，操作人員進入走廊然后進入準備間，并從準備間分別經過一更、二更、緩沖進入操作區。物流則由傳遞窗實現。排風口裝有高效過濾器，送風口裝有高效過濾靜壓箱，室內送排風曹勇上送下排方式，室內排風單側布置，不得有障礙。余壓閥自動調節室內壓力，保持正壓潔凈狀態。
②洗滌室：洗滌室房間的尺寸根據日常工作量決定，一般不小于一個單間，洗滌室的位置靠近培養室，給排水設施完善，洗滌臺面須耐熱耐酸，室內配器皿柜，滴水架，干燥架，邊臺等，地面應有良好的排水坡度和地漏。
③準備室：設實驗臺、試劑柜等要絕緣、耐熱、實驗臺要耐水耐腐蝕：設置上下水裝置，涉及粉末，篩分等操作，需配置相應的設備。局部排風，設排風柜。
④培養室：主要配置各種培養箱、搖床，要求溫度較恒定，有足夠的 電力供應。
（7）天平室：天平室宜采用雙層窗，以利隔熱防塵，同時為便于讀數而設窗簾箱。天平室通過門斗或前室進入，以免受氣流的影響。高精度微量天平、電子天平室應考慮有空調，且風速宜小。天平室內不得設置水盆或有任何管道穿過室內，以免管道滲漏、結露或在管道檢修時影響天平的使用和維護。天平室內盡量不要放置不必要的家具，以減少積灰。天平室應有全室一般照明和天平臺上的局部照明。局部照明可設在墻上或防塵罩內。
（8）放射室：設置位置與平面布置，宜在底層設置，自成一區，宜與門急診部、住院部鄰近布置，有便捷聯系。有條件時，宜采用病人通道與醫護工作人員通道分開的布置方式。
（9）更衣室
（10）實驗室
（11）綜合實驗室
（12）藥品室等
