根據我國現行GMP和《藥品檢驗所實驗室質量管理規范(試行)》有關實驗室的相關要求，藥廠質檢中心實驗室設計可根據一下方面來設置要求：
一、主要功能間
1、試劑、標準品室;
2、清潔洗滌區，如清潔室、消毒室、準備室、培養室;
3、一般分析實驗區，如化學實驗室、原輔料檢驗室、包材檢驗室、普通儀器窒、成品檢驗室;
4、資料存儲、數據處理區，如檔案資料室、電腦室;
5、留樣觀察室，包括加速穩定性考察室;
6、人員用室，如：更衣室、休息室;
7、特殊分析作業區。分為理化系統(如高溫室、精密儀器室、天平室、毒氣室等)和生物系統(如抗生素微生物檢定室、無菌檢查室、微生物限度檢定室等)。
二、主要功能間環境凈化設置
藥廠質檢中心環境參數的設置要求分為三類：
類是對功能間有空氣潔凈度要求的。
1、無菌檢查室、微生物限度檢查室和抗生素微生物檢定室，應分開設置;
2、無菌檢查室、微牛物限度檢定室應為無菌潔凈室，室內凈化級別不應低于l萬級，操作區應設置局部100級單向流裝置;
3、對抗生素微生物檢定室，其凈化級別至少應為10萬級。
第二類是對功能間有溫、濕度要求的;
1、如加速穩定性考察室的環境參數通常為：溫度40℃，濕度75%;對天平室、精密儀器室主要是要求除濕。
第三類是普通的辦公區等，沒有特殊要求，像毒氣室則要求有專用的排氣設施。
三、空氣凈化系統及輔助設施
1、人凈設施
確認空氣潔凈度的等級要求，在進入潔凈區的工作人員需更衣，目的是阻止灰塵進入。為了避免交叉污染，1萬級無菌室、1萬級非無菌室和10萬級潔凈室的人員凈化設施應分別設置。在進入不同的潔凈室時，應更換相對應的潔凈衣。
2、物凈設施
物料凈化是指對生產、操作所用的原輔物料、試劑、半成品、包裝材料等的凈化，進入無菌室的物品和物凈設施應按無菌要求處理和設置。物凈設施有：傳遞窗(帶紫外線殺菌)、外清間、消毒間、緩沖間、工器具清洗間等相關設施。
