通風柜內放置裝備或儀器時，其擺放位置會影響通風柜內氣流形態，當操作人員站在通風柜前方時，會造成一股渦流，而此時如果操作人員前方物品置放位置不正確時，將會導致這種逆流及擾流的情形加重。
為此提供幾種建議做參考：
1、器材應盡量于靠通風柜內部深處放置，并應至少距離調節門15至20厘米。
2、若因裝備過長而將其伸出調節門外，或置放之位置足以影響調節門之開啟或關閉。
3、當放置設備高度超過10厘米時，此設備下方需要有氣流通道，可使用不銹鋼支架將設備架高，中空型或孔狀支架可以降低對氣流形態之干擾。
4、應避免在通風柜內置放過多的設備及儀器，在通風柜內的裝備或其它設備總面積不得超過臺面板面積50%。
5、通風柜內如須使用需用電源之設備或儀器時更應注意，該設備應接地，以降低火花產生的可能性。電源線應從下方進氣口處拉出，外接電源插座，電源插座也應有完善及經過認證的接地設施。
6、柜內有產生高熱負載設備，其熱源將會造成柜內氣流變化，影響通風柜玻璃視窗開口下方的表面風速。熱氣流會增加玻璃視窗開口下方的表面風速，開口上半部的表面風速降低。
7、由于一般在通風柜內的上方以及調節門的后方都會有逆流及渦流的存在，所以應盡量避免在這兩個部位產生大量之氣流擾動。
8、大型設備對氣流的影響
通風櫥內的大型設備對進入通風櫥的氣流阻礙影響很大，氣流在其正面會產生渦流回到室內環境中，其較好的解決辦法為墊高大型設備，使其四周的氣流都能通暢進入通風櫥，降低逸出風險。
