生物安全柜廣泛應用于大專院校、科研院所、藥廠、衛生防疫等單位，是微生物實驗操作的主要潔凈設備，可防止可能存在的有毒有害懸浮顆粒的擴散，保護實驗過程中操作者和環境的安全，也可保護操作過程中樣品免受污染。
生物安全柜的等級： 一級：相當于帶過濾器的排毒柜功能，保護操作者和環境。二級：同時保護操作者，環境和樣品，適用于生物安全1、2、3級的樣品。三級：同時保護操作者，環境和樣品，操作環境與外界環境*隔離，帶有手套箱，全密式操作，適用于高危險性樣品的實驗操作。
生物安全柜主要是保護操作者和環境，也可保護樣品，結構比潔凈柜復雜，操作區氣體負壓，氣體凈化后排放；潔凈柜保護操作樣品，不保護操作者及環境，操作區處氣體正壓，操作區外氣體直接排放。
