農村化糞池中的糞便發酵后會產生大量的沼氣，俗稱甲烷，而且，這里面的氣體也不是單一氣體而是一種混合氣體，是由硫化氫、二氧化碳、甲烷、乙烷等氣體組成，其毒性對人體非常有害，如：硫化氫的毒性作用是切斷人體對氧的利用，造成人體細胞缺氧而窒息。

　　農村化糞池處于一種極度缺氧的環境，被比重大的氣體(如二氧化碳)擠占，氧氣含量低施工人員進入后極易缺氧而窒息。即使不缺氧狹小空間存在的甲烷或沼氣等，也會導致人身傷害。

　　生物病原體如細菌、病毒、鉤端螺旋體等經皮膚進入人體致病，所以，清理農村化糞池一定要注意以下幾點。

　　1、打開農村化糞池井蓋后，一定要先通風半小時以上，人不能站在化糞池旁邊，堅決不能在化糞池旁邊點火、吸煙或接打手機，以防沼氣著火或爆炸，造成人員傷害和財產損失。

　　2、工作人員切勿下到化糞池內工作，以免中毒或陷入水中，確需進入農村化糞池中，需要帶好防毒面具和穿好防毒服，并系好安全帶，安全帶的另一端，要捆在露在化糞池外的穩定固定物上，做好相關防護措施。

　　3、清理一個農村化糞池至少需要5人，有一人下到池里，池上面需要有兩人穿好防毒服，備好防毒面，隨時觀察化糞池里的情況，另外其他兩人做好防備工作。

　　4、農村化糞池需要定期進行清理，清理時一定要注意保證清潔人員的安全，其清理周期與糞便污染的溫度、氣溫和排水質量等都是相關的，以農村人員實際人口而定。