據《日本經濟新聞》2012年2月17日報道，日本制藥企業與富士通及東京大學合作，今年9月將使用超級計算機“京”進行抗癌藥物的研發，利用其強大的計算功能，進行分子結構分析以及從眾多化學物質中篩選有效成分等，預計數據分析時間將縮短至半年到1年，是原來所用時間的十分之一，可大幅度壓縮研發成本。參與研發的中外制藥、興和、富士膠卷三家公司將探索抗胃癌和大腸癌的新藥，力爭在明年3月之前找到可靠線索，為商品開發作準備。     

    傳統抗癌藥的篩選方法一般在試管里確認其藥效，試驗周期相當漫長，而超級計算機篩選可將癌細胞特具的蛋白質與可能有效的藥物物質結合狀況通過計算模擬，發現*組合物質，還可在原子、分子級水平設計物質結構。由于計算量龐大，一般計算機難以勝任，“京”具有每秒1京次的運算能力，在它的幫助下，可望將新藥開發時間（包括臨床試驗）控制在5年左右。此次合作開創了企業商業性應用超級計算機“京”之先河。

        為用超級計算機“京”開發抗癌藥物，開發團隊今年3月還將啟動與瑞典斯德哥爾摩大學的軟件合作，納入9月的正式研發工作中。