如何利用在線資源研究癌癥基因組

時(shí)間：2012-3-8閱讀：493

癌癥基因組研究無(wú)疑已成為癌癥研究領(lǐng)域的一大熱點(diǎn)，而且這種研究技術(shù)無(wú)需研究人員十分扎實(shí)的生物信息學(xué)基礎(chǔ)，就能獲得*——癌癥研究人員已經(jīng)積累了不少小突變，拷貝數(shù)變異，表觀遺傳學(xué)變化，表達(dá)水平差異的分析數(shù)據(jù)，以及大量癌癥類型的臨床特征數(shù)據(jù)，早在2008年科學(xué)家們就公布了*癌癥基因組序列（急性髓細(xì)胞白血病）。

這意味著目前進(jìn)入這一領(lǐng)域研究的相關(guān)科研人員將能獲得更多，更高質(zhì)量的信息，當(dāng)然研究分析不是一件容易的事情，正如Dana Farber癌癥研究所的副教授William Hahn所說(shuō)的那樣，“要想了解這些信息，并掌握如何運(yùn)用的方法，是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。”

近期生命科學(xué)期刊The Scientist雜志以“Combing the Cancer Genome”為題，介紹了癌癥基因組研究中一些有效的在線資源，以及如何運(yùn)用，可謂是這方面研究的指引手冊(cè)。

文章指出，目前可獲取的基因組數(shù)據(jù)來(lái)自幾個(gè)大型合作組織，癌癥基因組圖譜研究計(jì)劃（Cancer Genome Atlas pilot program，TCGA）就是其中一項(xiàng)，這是一項(xiàng)由美國(guó)國(guó)立癌癥研究所和美國(guó)國(guó)家人類基因組研究合作進(jìn)行的項(xiàng)目，于2005年晚期啟動(dòng)，目標(biāo)是“測(cè)試一種大規(guī)模、系統(tǒng)性分析癌細(xì)胞基因組變化的方法的可行性”，為檢測(cè)、治療、預(yù)防癌癥提供基因組信息。

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