日本國立神經醫療研究中心對43名重度抑郁癥患者和57名健康者腸內細菌對比后發現，抑郁癥患者人群有益菌雙歧桿菌和乳酸桿菌的數量明顯少于健康人群。這一研究結果顯示，有益菌少的人患抑郁癥風險較高。

日本目前接受抑郁癥治療的患者約有70萬人，而未接受治療的患者據推測超過治療者數的3至4倍，是威脅日本人健康的主要疾病之一。人們一般認為，抑郁癥病因是神經遞質異常、應激反應的內分泌異常以及慢性炎癥等生物學原因，但對抑郁癥并沒有更多的了解。人類腸道有1000多種細菌，數量超過100萬億個，總重量約為1至1.5公斤。這些細菌從食物中吸收營養，合成維生素及蛋白，防止外界病原菌侵入人體，承擔著極其重要的任務。

研究小組以43名抑郁癥重癥患者和57名健康者為對象進行了研究。他們從被試驗人員的糞便中采集雙歧桿菌和乳酸桿菌，用16S rRNA遺傳基因逆轉錄定量PCR方法分析發現，抑郁癥重癥患者的雙歧桿菌數明顯低于健康者；乳酸桿菌總菌數也同樣偏低。在有關分析中，雙歧桿菌臨界值（每克糞便中109.53個）以下的抑郁癥重癥患者人數比為49%（21/43人），健康人群為23%（13/57人），每克便中雙歧桿菌數少于109.53個時，抑郁癥重癥患者發病風險增加3倍；乳酸桿菌數量在每克便中少于106.49個時，抑郁癥重癥患者發病風險增加2.5倍。研究小組還發現，在被試驗者中，并發過敏性腸綜合征的比率在抑郁癥重癥患者中明顯增高。

這份刊登在《情感障礙》雜志網絡版的研究成果，報告了有益菌數量少易導致抑郁癥發病風險增加，也發現過敏性腸綜合征這種應激性身心病也與有益菌有關。乳酸菌飲料和酸奶等益生菌的攝取可能對抑郁癥的預防和治療有效。