從純凈水生產中選擇消毒方法主要有兩種：一種是紫外線消毒，另一種是臭氧消毒。UV消毒因其消毒強度小，無滯后消毒作用。目前，行業內使用廠家逐漸減少。如今越來越多的純凈水生產廠家選擇臭氧消毒方法。
一，純凈水生產用水處理臭氧發生器的產生途徑。
目前生產各類飲用純凈水和礦泉水的生產廠家所用的臭氧滅菌發生器主要有兩種類型：一種是以空氣為氣源，空氣經過壓縮、凝結、過濾、干燥等預處理凈化后，進入高壓放電管內，在高壓放電環境下，部分空氣中的氧分子被激發分解成氧原子，再與氧原子結合形成臭氧。該法案的一個缺點是噪音。二是以純氧為氣源，經硅膠干燥后進入放電網絡，產生臭氧氣體，由氧源發生器產生臭氧濃度高、純凈、無噪音，并可克服空氣源發生器使用一段時間后，易使處理水產生異味的缺點。不足之處在于需要頻繁更換氧氣瓶。

臭氧與純凈水混合的方法和步驟。
有兩種方法可以將臭氧與純凈水混合：一種是將臭氧與水混合，在臭氧-水混合塔內與水混合，形成灌裝水。塔中可填充一定數量的填料，增加其傳質系數，提高臭氧濃度。另外一種混合方式是：臭氧進入-噴射器(文丘里管)，然后在一個固定的螺旋混合器中與水充分混合，形成湍流。這種方法具有傳質系數高、水中臭氧濃度高、占地面積小等優點，比較適合于用氧氣作為氣源的裝置。
在純凈水生產用水處理臭氧發生器與水混合后，可操縱直到充填為止。
在水中，臭氧與純凈水的混合物的半衰期主要取決于水溫，高水溫下半衰期短，低水溫下半衰期長。通常在15-40毫安之間。這些都對生產飲用純凈水的企業的生產工藝提出了更高的要求。部分生產企業生產工藝不合理，生產操作不規范，是造成灌裝水中臭氧濃度偏低的主要原因。