由于臭氧在水中對細菌、等微生物的殺滅率高，速度快，對有機物等污染物的殺滅*，不會造成二次污染，所以飲用水消毒是臭氧應用中主要的部分，自來水行業是臭氧的較大市場。
        (1)臭氧發生器在飲用水的應用:氯消毒是一種非常常見的消毒方法。而臭氧對細菌的殺滅速度更快，殺滅效果更好。氯消毒對水質酸堿度變化尤其敏感，酸堿度從7.5升至8.0氯濃度增加2.5倍，臭氧濃度變化不大。用臭氧代替氯消毒目前主要的因素，也是美國、日本等傳統使用氯消毒的國家迅速發展的主要原因，因為水源受到有機工業產品的污染，氯消毒后就會產生氯、溴二氯甲烷、等氯化有機物(THM)，這些有機物具有致癌性，而在臭氧處理中不會產生二次污染化合物。目前，國內對瓶裝水采用臭氧凈化工藝為普遍和積極，粗略估算，礦泉水、純水、凈水廠已有一千多家，約60%的企業已經使用過該工藝。無臭氧設備的瓶裝水廠很難在市場上競爭，因為技術監督已經達成共識。由于市場需求的不斷擴大，國內已發展出大量的臭氧設備生產企業。臭氧發生器，投加混合設備的種類繁多，質量參差不齊，甚至偽造假水，使得瓶裝水的質量無法保證。其中的關鍵是處理水應達到0.3~0.5mg/L的臭氧溶解度值，這首先要求投加臭氧的量要滿足1m3的水2g的臭氧條件，同時要保證水----氣充分接觸，并保持一定時間。在實際工作中，當臭氧發生濃度超過8mg/L時，很容易達到溶解度要求。

       (2)臭氧發生器在污水處理中的應用:污水處理包括城市污水、工業污水和醫療污水的處理，其主要目的是消毒滅菌，去除污染物，脫色除味，達到排放標準。近年來，由于水資源緊缺，工業和生活污水回用問題突出，行業主管部門出臺了相關法規，提高了處理標準。70年代初，美國開始使用臭氧來處理生活污水，其主要目的是進行消毒，減少生物(BOD)和化學(COD)消耗，去除亞硝酸鹽、懸浮物和脫色，目前已經達到生產應用的程度。在日本，當污水經過臭氧處理后，在缺水地區循環成為非食用水(即中水)。用于電鍍含氰廢水的工業廢水臭氧處理，紡織印染廢水的脫色，精制污水的去酚，烷烴等。近年來，美、日、德、法等國都建立了大型污水處理廠，在我國煉油、印染等行業進行了試點應用。

       (3)臭氧發生器消毒在游泳池中應用廣泛，池水中臭氧消毒效果和優點已得到人們的普遍認可，國外應用極為普遍。我公司在廣州的天河游泳館、北京亞運村英東游泳館等均采用臭氧消毒，池內水質清澈透明，*解決了氯消毒刺激眼睛、皮膚和毛發發黃的問題。