離子交換層析根據化合物的凈電荷進行分離。帶負電荷或正電荷的官能團共價結合于固相載體基質，分別成為陽離子交換劑和陰離子交換劑。當一個帶電荷的分子加入到帶有相反電荷的交換劑時，它就會被吸附，同時，帶相同電荷的離子和中性分子則被洗脫到層析柱的外水體積里。帶電荷分子的結合是可逆的，通?？捎名}或PＨ梯度洗脫吸附的分子。
離子交換層析可以有多種應用，包括分離和純化生物分子，分離無機離子，試劑和水的去離子化，鹽轉換以及去除金屬離子、溴化乙錠和ＳＤＳ。
兩性化合物的分離策略。如果分子在ＰＨ高于其等電點時穩定，可使用陰離子交換樹脂。如果分子在ＰＨ低于其等電點時穩定，則使用陽離子交換樹脂。
美國GE（原安瑪西亞）層析填料（常用型號）
| 離子交換填料： | 規格 |
| 17-0510-01QSepharoseF.F | 300ml |
| 17-0510-04QSepharoseF.F | 5L |
| 17-0510-05QSepharoseF.F | 10L |
| 17-0729-01SPSepharoseF.F | 300ml |
| 17-0729-04SPSepharoseF.F | 5L |
| 17-0729-05SPSepharoseF.F | 10L |
| 17-0709-01DEAESepharoseF.F | 500ml |
| 17-0709-05DEAESepharoseF.F | 10L |
| 17-0719-01CMSepharoseF.F | 500ml |
| 17-0719-05CMSepharoseF.F | 10L |
| 17-1275-02SOURCE30Q | 200ml |
| 17-1275-03SOURCE30Q | 1L |
| 17-1014-03QSepharoseH.P. | 1L |
| 17-1087-03SPSepharoseH.P. | 1L |
環保在線