常見的病菌是腸道傳染病菌，每升污水可達幾百萬個，可傳播霍亂、傷寒、腸胃炎、嬰兒腹瀉、痢疾等疾病。常見的寄生蟲有阿米巴、麥地那絲蟲、蛔蟲、鞭蟲、血吸蟲、肝吸蟲等，可造成各種寄生蟲病。病毒種類很多，僅人糞尿中就有百余種，常見的是腸道病毒、腺病毒、呼吸道病毒、傳染性肝炎病毒等。

食品加工污水處理器廢水綜合處理設備光化學混凝法、氧化—吸附法、焚燒法、萃取法、濕式催化氧化法、電化學法和膜分離法等。單獨利用物化法處理高濃度有機廢水，不僅處理難度大、成本高，并且處理效果也不夠好，一般很少單獨使用。生物處理法是利用生物降解水中的污染物質作為自身的營養和能源，同時使廢水得到凈化的方法。

生物接觸氧化法，是一種介于活性污泥法和生物濾池兩者之間的污水生物處理技術，兼備兩者的優點。其主要構筑物為生物接觸氧化池，池內充填填料，已經充氧的污水浸沒全部填料，并以一定的流速流經被其浸沒的填料，在填料上形成生物膜，污水與生物膜廣泛接觸，在生物膜上微生物的新陳代謝功能的作用下，污水中有機污染物得到去除，污水得到凈化。

由于池內具備適于微生物棲息增殖的良好環境條件，因此，生物膜上微生物相當豐富，食物鏈長、微生物濃度高、活性強，不產生污泥膨脹，污泥生成量少，且易于沉淀。生物接觸氧化法具有多種凈化功能，除有效地去除有機物外，如運行得當，還能夠脫氧和除磷。傳統的蜂窩狀塑料管較易堵塞，現在常采用吊掛式軟性填料和懸浮或半懸浮球形填料，能有效地防止堵塞，且面積較大，處理效果好。

食品加工污水處理器廢水綜合處理設備MBR工藝把含高濃度MLSS的活性污泥處理和超濾膜系統相結合。總體上，該工藝利用中空纖維膜替代了傳統活性污泥法的二沉池和深度處理中的砂濾或微/超濾系統。