原子熒光和原子吸收都是光譜，原理稍微有些不同。原子熒光的特長是測量As，Se，Hg等一些過度元素和特殊的金屬元素。原子吸收分火焰和石墨爐兩種，主要測量重金屬元素，石墨爐原子吸收測量重金屬元素也可以達到ug/L級別。原子熒光和原子吸收在實驗室里沒有ICPMS的情況下作為互補，可以測量大部分金屬元素和過度元素。具體誰更有*性，檢測限更低要根據具體的元素來定。
具體有以下三個方面：
1、光路不同：原子吸收光源、原子化器和檢測器在一條光路上；原子熒光為垂直光路。
2、原理不同：原子吸收利用原子的特征吸收光譜；原子熒光則利用原子的激發-躍遷光譜（熒光）。
3、靈敏度不同：對于原子吸收，增加光源強度同時會增加背景吸收，而原子熒光信號強度與激發光源強度成正比，故靈敏度可以極大提高。
