倒置顯微鏡是指在高倍復式顯微鏡下，利用顯微操作器進行細胞或早期胚胎操作的一種方法。倒置顯微鏡是用以控制顯微注射針在顯微鏡視野內移動的機械裝置。zui常用的觀察方法就是相差。由于這種方法不要求染色，是觀察活細胞和微生物的理想方法。在此提供各種聚光器來滿足需要，這種方法提供帶有自然背景色的、高對比度的、高清晰度的圖像。
倒置顯微鏡的使用可分為2個步驟，即開機與關機，方法步驟如下：
開機。接連電源。打開鏡體下端的電控開關。
（1）準備：將待觀察對象置于載物臺上。旋轉三孔轉換器，選擇較小的物鏡。觀察，并調節鉸鏈式雙目目鏡，舒適為宜。
（2）調節光源：推拉調節鏡體下端的亮度調節器至適宜。通過調節聚光鏡下面的光柵來調節光源的大小。
（3）調節像距：轉三孔轉換器，選擇合適倍數的物鏡；更換并選擇合適的目鏡；同時調節升降， 以消除或減小圖像周圍的光暈，提高了圖像的襯度。
（4）觀察：通過目鏡進行觀察結果；調整載物臺，選擇觀察視野。
關機
取下觀察對象，推拉光源亮度調節器至zui暗。關閉鏡體下端的開關，并斷開電源。旋轉三孔轉換器，使物鏡鏡片置于載物臺下側，防止灰塵的沉降。
我們在使用倒置顯微鏡的同時，細節也不能疏忽：
所有鏡頭表面必須保持清潔，落在鏡頭表面的灰塵，可用吸耳球吹去，也可用 軟毛刷輕輕的撣去掉。
不能用有機溶液清擦其它部件表面，特別是塑料零件，可用軟布蘸少量中性洗滌劑清擦。
當鏡頭表面沾有油污或指紋時，可用脫脂棉蘸少許無水乙醇和的混合液（3:7）輕輕擦拭。
在任何情況下操作人員不能用棉團、干布塊或干鏡頭紙擦試鏡頭表面，否則會刮傷鏡頭表面，嚴重損壞鏡頭，也不要用水擦試鏡頭，這樣會在鏡頭表面殘留一些水跡，因而可能滋生霉菌，嚴重損壞顯微鏡。
顯微鏡盡可能不移動，若需移動應輕拿輕放，避免碰撞。
儀器工作的間歇期間，為了防止灰塵進入鏡筒或透鏡表面，可將目鏡留在鏡筒上，或蓋上防塵塞，或用防塵罩將儀器罩住。
不允許隨意拆卸儀器，特別是中間光學系統或重要的機械部件，以免降低儀器的使用性能。
