填料相關問題在曝氣生物濾池中起處理作用的微生物主要是生長在填料上設計負荷必須都是以填料為基礎進行計算的，確切的說該是落實到單位比表面積上的負荷，所以比表面積不同，所承受的負荷也是不相同的，而通常的設計是按填體積來計算的，這種計算方式科學性值得推敲。
在工程應用過程中填料出現問題有：
①填料粒徑不均勻，破碎的填料或小填料比較多。這種填料應用存在問題有：造成反沖洗困難，填料有效空間過小，填料層外孔隙被占用，影響生物膜的正常生長，也造成污水在填料中的實際停留接時間縮短，從而影響處理效果。
②填料堆積容重問題。填料堆積容重過大固然不好，但也存在容重過輕現象，分析原因有：填料加工過程不同，有些填料是用天然頁巖等材料制成的，所以過輕;燒制填料燒制所用成孔劑用量過多，溫度控制不當也會造成填料堆積容重過輕。這類填料應控制填料堆積容重，使其不因反沖洗而流失，控制其破碎磨損率及簡壓強度使其不易破碎磨損。
處理辦法有：針對燒制填料應控制燒結溫度和成孔劑的添加量，以保證產品質量，使用單位應加強對每批次產品的到貨質量控制。作為輔助控制，應在反沖洗排水渠前端設置柵形棄流擋板，以防止填料流失。
通常曝氣生物濾池設計填料裝填高度都達3以上，有的工程填料裝填高度甚至達到4m以上，濾池的流態又以上向流居多，裝填高度過高加大了濾池反沖洗的難度。而據有關文獻報道，碳化濾池對有機物的截留和降解最主要集中在填料層下部2以下的空間，而曝氣生物濾池又以碳化濾池(以去除BOD為主要處理目的，通常用于一級生物濾池)截污最多，反沖洗最為困難，所以碳化濾池的填料裝填高度不宜設置的過高。
