傳統的手工菌落計數器由于使用環境和檢測流程，難免在計數倉部分對設備產生污染。由于手動價格低廉，往往難以拆卸或者清潔。部分國產廠家號稱可以放進滅菌設備中高溫高壓滅菌，殊不知這種滅菌方式對于設備的電子和機械結構傷害*

早期的菌落計數器，也沒考慮到交叉污染的問題，而且，由于早期功能限制，對于復雜生長情況的平皿，尤其是部分在蓋子上寫字的平皿，更是會對識別造成干擾，不打開蓋子就沒有辦法進行計數，不僅沒有起到簡化檢驗流程，提高檢驗自動化程度的作用，反而加長了檢驗時間，甚至對檢驗人員的安全健康造成了潛在威脅。
 計數器除了不斷提升Autocount智能識別技術的識別效果，使檢驗人員不用打開蓋子就能排除字跡和雜質的干擾。還采用了可以替換的樣品倉和暗倉結構，只需要簡單的步驟即可對有可能收到污染的樣品倉部分進行拆卸和替換，替換下來的組件可以進行清潔和消毒處理，作為下次替換的備用組件。
    另外可以選配UV組件，通過不同的波長，實現對顯色培養基的熒光觀察，也可通過UV方法直接對倉內進行滅菌。

準確快速的一鍵識別功能。常規菌落計數僅需直接點擊“識別”，一鍵可完成識別區域的判定，雜質的剔除，菌落數量的識別，對全平皿的計數分析僅需3秒。統一了識別標準、降低工作強度、提高檢驗效率，同時數據準確性和復現性也比常規計數有顯著提高。