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STR鑒定微衛星標記(Microsatellite)也稱為短串聯重復序列(STR)或簡單重復序列(SSR),是廣泛分布在真核生物基因組中的簡單重復序列,一般由一個長2~6bp的核心序列經多次串聯重復排列而成,重復次數大多在10~60次之間
微衛星標記(Microsatellite)也稱為短串聯重復序列(STR)或簡單重復序列(SSR),是廣泛分布在真核生物基因組中的簡單重復序列,一般由一個長2~6bp的核心序列經多次串聯重復排列而成,重復次數大多在10~60次之間。近年來,大量研究表明STR基因分型方法是進行細胞交叉污染和性質鑒定的和準確的方法之一,STR分型高效快捷,結果精確,是非常重要的遺傳標記,在基因定位、遺傳育種等領域有著廣泛的應用。STR基因分型應用于細胞鑒定已被ATCC等機構強烈推薦。美國的ATCC 細胞庫、德國的DSMZ細胞庫以及日本的JCRB細胞庫等為STR 分型提供了各細胞株的數據供比對。
微衛星位點通常通過PCR擴增和電泳檢測,并根據片段大小分離等位基因進行分析;擴增后的等位微衛星可以用多種方法檢測,傳統方法采用聚丙烯酰胺凝膠電泳加放射顯影或銀染的方法,費時費力效率低。利用ABI遺傳分析儀對熒光標記的DNA片段進行檢測,結合分子量內標進行DNA片段長度計算,使STR分型變得高效快捷,結果也更加精確。
STR鑒定實驗流程
1、實驗方案的設計,包括熒光標記的選擇,引物的設計、合成和標記、內標的選用等。
2、預實驗:確定PCR反應條件。
3、正式實驗:完成熒光PCR,并在測序儀上完成電泳掃描,數據采集,去掉低值數據,分析結果、補充測序、完成分析。
4、對收集的數據進行處理分析,提供產物片段大小、數量多少的信息數據。
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