醫療廢水處理設備設計工藝一般分為三級，不同的醫院根據國家要求采用不同等級：一級為隔渣、調節；二級為生化降解；三級為接觸消毒、過濾。消毒滅菌后便可排入城市污水，然后進入城市污水處理場，進行深度處理。
醫療污水的主要成分有：
1、醫療污水受到糞便、感染性細菌和病毒等病原性微生物污染，具有感染性，能夠誘發疾病或造成損傷。
2、醫療污水中含有酸、堿、懸浮固體、動植物油等有毒、有害物質。
3、牙科治療、洗印和化驗等過程產生污水含有重金屬、消毒劑、有機溶劑等，部分具有致癌、致畸或致突變性，損害人體健康并對醫療污水處理設備的處理辦法和工藝流程是根據處理目標而確認的，處理目標有懸浮物、飄浮物、有機物、放射性同位素、病菌、病毒、酸堿等。其間損害較大的是病原體。
醫療廢水處理設備運用二次生物接觸氧化處理工藝，它處理的效果超越全混合生物氧化池，對水質的適應性強度高，保證了水處理的穩定性。該設備在池中采用了新型彈性立體填料，對污水中的有機物質具有去除的功能，通過氧化處理之后，產生的污泥量較少，僅需90天排放一次即可。為了避免放生病菌滋生、傳播的現象發生，務必對水質進行深度消毒處理，目前應用多的消毒工藝有：紫外線消毒、二氧化氯消毒、臭氧消毒。操作簡單、出水水質好、維護方便、運行成本低。
(1)采用了臭氧發生器，其產生的臭氧對細菌、病毒等微生物內部結構有*的氧化破壞性，可達到殺滅細菌繁殖體、芽孢、病毒、真菌和原蟲胞囊等各種細菌，以及破壞肉毒桿菌的毒素及立克次氏體等。
(2)運行安全可靠，平時一般不需要專人管理，只需適時地對設備進行維護和保養。
(3)采用碳鋼防腐，不需要另外購買藥劑，設備經濟、緊湊、美觀、噪音低;
(4)采用成熟的工藝處理，具有良好的去除污水中的有機物和較好的脫氮功能，以滿足排放標準的要求；
