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在日常生活中，總會產生些污水主要包括納入城市污水收集系統的生活污水、醫療污水和工業廢水之混合污水。污水中含有大量微生物，包括腸道細菌、病毒以及原生動物胞囊等。這些微生物相當部分是致病菌。從而引起些水體傳染的傷寒、霍亂、肝炎、腸胃炎等疾病。所以污水處理廠必須要進行消毒，只有通過消毒水質才會改善，細菌含量也會大幅度減少。目前，污水處理廠消毒的方式有很多種，通過進行對比有效的方法就是通過次氯酸鈉發生器進行消毒，該設備消毒效果好，成本低，原理簡單，污水廠經過該設備消毒后，各項指標也都達到要求。
次氯酸鈉消毒目前在污水處理廠運用的消毒原理如下：
- 次氯酸鈉消殺主要的作用方式是通過它的水解形成次氯酸，次氯酸再進步分解形成新生態氧，新生態氧的*氧化性使菌體和病毒上的蛋白質等物質發生變化，從而致死病源微生物。
- 次氯酸在、殺病毒過程中，不僅可作用于細胞壁、病毒外殼．而且因次氯酸分子小，不帶電荷，還可滲透人菌(病毒)體內，與菌(病毒)體蛋白、核酸、和酶等有機高分子發生氧化反應，從而殺死病原微生物。
- 次氯酸產生的氯離子還能顯著改變細菌和病毒體的滲透壓，使其細胞喪失活性消逝。
