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制藥廢水的形成主要來源于四種生產類型：抗生素的生產、中成藥的生產、合成藥物的生產、各類醫藥劑的洗滌水。廢水成分多較為復雜，有機污染物類別繁多，主要包括生產過程中各類的原料和溶劑，伴隨著各種化學反應和副產物的形成，廢水的濃度較高，毒性較大，形成的顏色較深，生物降解極其困難。
1厭氧處理法：厭氧氧化法一般用來處理濃度較高的有機制廢水，單獨的厭氧處理后，出水COD含量仍然會很高，因此處理時會以好氧生物處理作為后處理，達到較好的效果。比較典型的技術有上流式厭氧污泥床法(UASB法)，又稱作流式厭氧污泥床。結構原理是將反應器底部設置高活性、高濃度的污泥床，污水逆流經過后，會經過厭氧發酵為甲烷(CH4)和二氧化碳(CO2)。UASB法結構簡單，效率較高，水利停留時間較短，但是技術要求嚴格，馴化困難。此外，水解酸化法也是厭氧處理方法之一，是經過UASB改進而來，改良后的優點是可將大分子有機污染物分解為小分子污染物，提高可生化反應;反應速度較快，小，成本降低，無需封閉，多加攪拌即可。
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