醫療廢水處理中水回用機構排出的含有大量病菌和其他有毒有害物質的生活廢水。按醫院性質可分為傳染病醫院廢水和綜合醫院廢水；按廢水成分可分為有放射性醫院廢水、廢棄藥物醫院廢水、含量金屬離子醫院廢水。 

醫療廢水處理中水回用處理流程如下： 
預處理+一級處理+二級處理+深度處理+消毒+出水 
改變醫院廢水水質的過程。主要是殺滅廢水中的致病微生物。為了提高消毒效果，在消毒前可對廢水進行預處理，包括一級和二級處理。 

消毒： 
消毒處理方法有氯化法、臭氧法、紫外線消毒法。氯化法消毒中主要有液氯法、投氯酸鈉和二氧化氯法等三種。 
為消滅廢水或污泥中的病原體或使之滅活而進行的處理過程。分為廢水消毒和污泥消毒。 醫院廢水處理主要是消毒，即殺滅病原體。醫院廢水的水質十分復雜，一般隨著用水量的增大，相應的污染物濃度也越來越高，醫院廢水處理流程應盡可能設調節池，調節池不但可以調節水量，消滅高峰負荷，并可以調節水質，使其處理效果不會因水質變化而受到干擾二氧化氯消毒劑的投加點一般選擇在調節池之后。浮選沉淀后經消毒池（由二氧化氯混合發生器制備的消毒劑）進行消毒后，達標排放。自發浮選沉淀池的剩余污泥排入調節池，調節池和接觸氧化池的污泥打入污泥消化池進行好氧消化處理可達標排放。 

接觸氧化+沉淀+消毒 好氧生化處理單元去除CODcr、BOD5等有機污染物，好氧生化處理可選擇接觸氧化、活性污泥和高效好氧處理工藝，如膜生物反應器、曝氣生物濾池等工藝。采用具有過濾功能的高效好氧處理工藝，可以降低懸浮物濃度，有利于后續消毒。膜生物反應器將膜分離技術與生物處理技術相結合的一種全新廢水處理技術主要由生物處理裝置曝氣池和膜分離組件組成廢水中的絕大部分有機物被微生物所分解膜分離組件將混合液中直徑大于膜孔徑的微粒和微生物截留下來得到可作為力水回用的處理出水或合格的排放水。 一級接觸氧化+一級沉淀+二級接觸氧化+二級沉淀+消毒 
廢水經提升后進入混凝沉淀池進行混凝沉淀，沉淀池出水進入接觸池進行消毒，接觸池出水達標排放。調節池、混凝沉淀池、接觸池的污泥及柵渣等廢水處理站內產生的垃圾集中消毒外運。消毒可采用巴氏蒸汽消毒或投加石灰等方式。 工藝選擇原則 
采用技術*，運行可靠，操作管理簡單的工藝，使*性與可靠性有機地結合起來。 利用高效節能的治理工藝，*地降低工程運行費用。 采用成熟的*技術工藝，有效控制工藝造價。廢水處理工藝以處理效果好，動力消耗低，運行穩定，管理方便的生化法為主；主要處理設備選用高效、運行穩定、操作維護容易的設備，以提高廢水處理效果、降低處理費用，使廢水處理后達到排放標準的要求。