圖書消毒實際上指的是清除或殺滅附著在圖書上和書庫中的有害細菌，圖書消毒要求將有害微生物的數量減少到無害的程度。即根據的標準，以微生物的殺滅率為99.9%來評價消毒效果，除此之外，對圖書進行消毒時，除了要考慮是否對人體健康有害之外，還需考慮到是否會損害圖書檔案本身，所以圖書消毒的方法大致分為以下幾類。
一、物理消毒就是應用物理因素去除或者殺滅細菌的一些方法。對圖書消毒常見有以下幾種：
1、自然除菌就是對于附著在圖書表面，館內空氣等的細菌及其它有害微生物，無需人力消毒，也可以逐步達到無害。這是靠大自然凈化的原因，例如風吹、干燥、低溫、日曬等，流通借閱的圖書如果攜帶的是一般細菌，暫停借閱放置在館內兩周也可達到自然凈化的效果。
2、機器除菌是利用一些專用機器的方式去除圖書表面的灰塵及其有害微生物。雖然不能殺滅細菌，但可以減少其數量，或減少受感染的可能。一般可使用檔案除塵器、空氣消毒凈化機等。
3、紅外線高溫輻射消毒，利用遠紅外快速對圖書進行消毒。對一般書籍消毒均有效果。
二、化學消毒使用化學劑所進行的消毒。消毒劑按劑型可分為：溶劑、熏蒸劑。但是消毒劑對人體有害，如果操作不當容易造成事故，所以工作時必須做好防護。
三、利用圖書專用消毒柜進行消毒，隨著時代經濟的發展，圖書消毒的需求也越來越大，市面上也出現了圖書消毒的產品，圖書消毒產品的種類也比較多，針對圖書館有自助圖書殺菌機、推車式圖書消毒倉，針對繪本館、企業單位有繪本圖書消毒柜，不同容積的圖書檔案消毒柜、文件檔案消毒柜等，操作簡單，利用紫外線+臭氧的殺菌原理，配合氣旋式送風裝置均勻吹開書籍，讓紫外線照射到，對書籍封面及內頁進行360°消毒，臭氧穿透性強，深如圖書內部，起到深層殺菌的效果。殺菌率高達99.99%，30秒就可完成殺菌作業。
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