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科學確定植物細胞核內RNA調控模式

時間:2017-5-16閱讀:877
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    zui近,在植物進行的一項新研究中,研究人員們以早期工作為基礎,在早期工作中他們將發生在RNARNA結合蛋白質之間的所有相互作用進行編目。這一次,他們僅在細胞核中研究這些相互作用,同時獲得關于核RNA分子結構的數據。通過結合這些數據集,他們的研究全面分析了可能影響RNA調控過程的模式,這些調控過程發生在這些分子進入細胞質之前,在那里它們轉化為蛋白質,從而構成一個活的生物體。

    此外,研究人員提供了一個巨大的、公開可用的數據集,其他科學家可以用來解決關于他們感興趣的基因及調控機制的問題,從而更好了解從DNA到蛋白質這一行程的動力學。

    研究小組稱,他們開發出一種方法,可對活生物體中RNARNA結合蛋白之間相互關系獲得一個完整的目錄。該技術被稱為PIP-seq,用于蛋白質相互作用譜測序。

    在當前的這項研究中,他們使用常用模式植物擬南芥(Arabidopsis thaliana),標出了所有RBP相互作用位點,也編譯出RNA轉錄子的完整二級結構。*項研究著眼于細胞內的所有RNA,一套被稱為轉錄組的材料,而這項研究卻只著眼于在細胞核。

    通過特別關注細胞核,我們可以避開RNA分子的所有特征——與轉錄成蛋白質的過程相關,這個過程發生在細胞質中。通過集中研究與RBPs相結合的RNA部分,該研究小組發現,這些序列在進化史中已經變得保守,可能在基因調控機制中發揮重要的作用。

    兩種關鍵的轉錄調控形式是:可變剪接,其中RNA片段經歷了剪切和粘貼過程,以產生可編碼不同蛋白質的新序列;和可變聚腺苷酸化,它會改變一個轉錄子結束和一個腺嘌呤“尾巴”添加的位置,這個過程可以提高RNA分子的穩定或降解。

 

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