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科學家確定健康結腸組織中遺傳變化的模式,從而發現了癌癥的早階段
研究發現了健康結腸組織中遺傳變化,這一團隊開發了對少數結腸細胞的基因組進行測序的技術,從而使他們能夠以的方式研究遺傳突變。從中研究人員發現了復雜的突變模式,包括癌癥基因的變化,以及個體內部,個體與個體之間的巨大差異。
癌癥是一種遺傳性疾病,是由特定基因的遺傳突變引起的,這種突變可以使細胞比其鄰居更具優勢。在某些基因中發生足夠的突變后,細胞可能會癌變,不受控制地分裂形成腫瘤。
在過去的40年間,科學家們已經確定了這些驅動癌癥的突變,并在腫瘤組織中標出了這些突變。但由于技術限制,以前不可能在健康組織中鑒定它們,而這對于理解癌癥發展的步至關重要。
在這項新研究中,研究人員開發了確定和表征健康結腸細胞基因組序列的方法,由此發現了結腸癌發展的早階段。這些細胞形態正常,但是具有明顯的遺傳變化模式,包括重要的癌癥基因。
研究人員說:“我們的細胞中存在著一個以前從未發現過的基因突變的全貌。我們發現了那些如果在癌細胞中看到的話,就會被認為引發癌癥的突變,實際上也存在于在顯微鏡下看起來*正常的健康結腸組織中。我們已經證明這些突變細胞很多,不過絕大多數不會繼續致癌。”
為了識別突變,研究小組使用激光捕獲顯微鏡從樣品中切出了單個的“crypts”,這些結構構成了結腸組織。crypts內的每個細胞都有相同的遺傳突變。他們研究了42位年齡在11至78歲之間的2,035個crypts。
研究所開發了一種新的工作流程,可以對激光捕獲crypts的基因組進行測序。然后,該團隊實現了*自動化,從而能對成千上萬的基因組快速測序。
研究人員說:“我們的目標是找到一種方法,對從顯微鏡載玻片上獲得的僅數百個細胞的基因組進行測序,這是我們以前從未做過的方法,該方法現現在已用于處理40,000多個激光捕獲樣品,還適用于其他只有少量DNA的項目,例如對寄生血吸蟲進行測序。這是一項強大的新技術。”
研究小組還分析了基因組中的突變特征的模式,他們在結腸細胞中發現了多個突變過程的特征。以前已經發現過一些,現在找到了以前從未見過的一些,需要進一步研究找出導致它們的原因。
鑒定健康細胞中癌癥驅動基因的突變特征和突變,可以給出正常結腸組織中DNA變化的基線圖像。將這些突變與在炎性腸病以及結腸癌等疾病中所見的突變進行比較,就可以了解細胞如何以及為何在健康和疾病中進化和改變的。
研究人員說:“能夠在正常細胞中發現突變的能力,意味著我們現在可以描述人體不同組織中存在多少種突變,以及什么類型的突變。在本研究中,我們在正常結腸細胞的基因組中鑒定了新的突變模式——‘突變特征’,從而提供了導致這些突變原因的線索。因此可能可以幫助我們找到導致結腸癌的隱藏原因。”
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