疾控中心廢水處理的程度，主要是根據污水的排向而定，本著安全、環保、節能、減排、增效的基本原則，選擇技術前瞻、工藝可靠、工程投資經濟、處理效果穩定、處理流程簡化、運轉費用經濟、操作管理簡單的污水處理工藝。
疾控中心污水消毒設備
專業疾控中心廢水處理設備：
消毒設備即：二氧化氯發生器，醫院污水處理主要是消毒，即殺滅病原體。常用的方法是二氧化氯消毒的工藝原理。二氧化氯應用于醫院污水的殺菌消毒的處理工藝流程圖如下所示：醫院污水的水質十分復雜，一般隨著用水量的增大，相應的污染物濃度也越來越高，為緩解這一情況，醫院污水處理流程應盡可能設計調節池，調節池不但可以調節水量，消滅高峰負荷，并可以調節水質，使其處理效果不會因水質變化而受到干擾二氧化氯消毒劑的投加點一般選擇在調節池之后。為保證取得良好的殺菌效果，污水和消毒劑在接觸消毒池中停留時間一般不應小于1小時BSD系列二氧化氯發生器還可根據流量信號或其他信號自動控制發生器的運行，確保接觸消毒池中二氧化氯的濃度，*殺滅有害微生物
疾控中心污水消毒設備
排放標準：要達到排放標準就要使用生化設備即：地埋式一體化醫療廢水處理裝置。地埋式一體化生活廢水處理設施是以缺氧和接觸氧化組成的生化處理工藝為核心的成套污水處理設備，地埋式設備特點是：
1、集約化程度高，把各種水處理工藝有機組合為一體，去除效率高。
2、由于組合科學，容積利用率高，可埋入地下，節省投資，運行費用低。
3、設備的運行均為微電腦自動化控制，管理維護方便。
4、設備運行基本無噪音，無異味，對周圍環境無任何影響。
5、設備規格齊全，設計選型方便。
6、造價低，占地面積小，地埋式一體化生活醫療污水處理設備地埋機適用于已有化糞池或污泥消化池的場合。
7、地埋設備脫氮除磷效率高，污泥產量低。地埋式生活污水處理設備工作原理生活污水進入化糞池或水解調節池。經化糞池調節使廢水的水量和水質保持恒定均勻，以便以后繼續處理。調節后的污水經污水泵提升到設備的初沉淀池，使大顆粒及一部分污染物沉淀。沉淀后的上清液自動流進接觸氧化池，進行生物接觸氧化處理，去除和降解污水中的有機物。經接觸氧化后再由自發浮選沉淀池去除懸浮物及污染物。浮選沉淀后經消毒池（由二氧化氯混合發生器制備的消毒劑）進行消毒后，達標排放。自發浮選沉淀池的剩余污泥排入調節池，調節池和接觸氧化池的污泥打入污泥消化池進行好氧消化處理可達到GB18466-2005醫院污水排放標準；
疾控中心廢水的水質特點是含有大量的病原體──病菌、病毒和寄生蟲卵。如結核病醫院污水，每升可檢出結核桿菌幾十萬至幾百萬個。醫院污水還含有消毒劑、藥劑、試劑等多種化學物質。利用放射性同位素醫療手段的醫院的污水還含有放射性物質。醫院污水的水量與醫院的性質、規模及所在地區的氣候等因素有關，按每張*計一般為每天200～1000升。 醫院污水處理主要是消毒，即殺滅病原體。常用的方法是氯化消毒或用臭氧消毒（見水的消毒、廢水氧化處理法）。
