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基因組編輯的下一個目標(biāo):表觀基因組

時間:2016/9/21閱讀:274
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CRISPR技術(shù)在生命科學(xué)領(lǐng)域刮起了一陣旋風(fēng)。如今,表觀基因組的編輯又成為一個新的熱點。人們對染色質(zhì)和表觀遺傳修飾進行操控,希望借此了解它們對基因組和細胞功能的影響。在新一期的《Genome Biology》上,波士頓大學(xué)等機構(gòu)的研究人員發(fā)表綜述,介紹了這方面的進展。

染色質(zhì)的DNA和組蛋白上存在著大量的生化修飾。這些修飾提供了重要的附加信息,因此被稱為表觀基因組。大量研究表明,表觀基因組在調(diào)控基因組的結(jié)構(gòu)和功能上發(fā)揮關(guān)鍵作用,包括基因表達的時機、強度和記憶。同時,表觀基因組的改變也與許多人類疾病存在關(guān)聯(lián),包括大多數(shù)癌癥。

然而,對于表觀基因組的功能,我們還有很多不甚了解的地方。因此,基因組編輯工具的出現(xiàn),為研究人員帶來了一道曙光。這些工具能夠在特定時間編輯特定位點的染色質(zhì)修飾,讓研究人員直接拷問表觀基因組與轉(zhuǎn)錄調(diào)控之間的關(guān)系,并加深對其功能的了解。有關(guān)發(fā)育和疾病的研究更有望造福人類。

近年來,基因組編輯技術(shù)不斷涌現(xiàn),包括鋅指核酸酶(ZFN)、類轉(zhuǎn)錄激活效應(yīng)物(TALE)和CRISPR/Cas系統(tǒng)。如今,這些技術(shù)被用于定向的表觀基因組編輯,將功能元件招募到感興趣的DNA區(qū)域。然而,染色質(zhì)是一個復(fù)雜且動態(tài)的調(diào)控系統(tǒng),在實際應(yīng)用中面臨著*的機遇和挑戰(zhàn)。

在這篇綜述中,作者回顧了表觀基因組改造的當(dāng)前狀況。具體來說,這些新的工具主要用于研究染色質(zhì)的四個主要特征:染色質(zhì)修飾的生化多樣性;染色質(zhì)修飾的組合;修飾的記憶和長期穩(wěn)定性;以及遠距離空間調(diào)控的可能。作者強調(diào)了設(shè)計上的考慮和挑戰(zhàn),也提出了一些解決問題的策略。

作者指出,表觀基因組改造的進展對了解調(diào)控的潛在機制以及設(shè)計新的方法來調(diào)控基因有顯著的影響。正向改造方法讓研究人員能夠直接拷問表觀基因組與轉(zhuǎn)錄功能之間的關(guān)系。這些方法可與其他細胞生物學(xué)方法互補,對系統(tǒng)探索大型參數(shù)空間特別有用。zui終,表觀基因組編輯有可能成為新形式的基因治療,來修飾或校正與疾病相關(guān)的表觀基因組狀態(tài)。

“考慮到表觀基因組在自然界中的廣泛應(yīng)用,我們有理由相信,表觀基因組編輯,以及染色質(zhì)修飾的操作,將成為合成生物學(xué)和生物工程的新模式。表觀基因組將不再是一個有待破譯的復(fù)雜問題,而是一個可利用的強大平臺,”作者寫道.

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