一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/strong>
學(xué)習(xí)和掌握瓊脂糖電泳法鑒定DNA的原理和方法。
二、實(shí)驗(yàn)原理
瓊脂糖凝膠電泳是用于分離、鑒定和提純DNA片段的標(biāo)準(zhǔn)方法。瓊脂糖是從瓊脂中提取的一種多糖,具親水性,但不帶電荷,是一種很好的電泳支持物。DNA在堿性條件下(pH8.0的緩沖液)帶負(fù)電荷,在電場中通過凝膠介質(zhì)向正極移動,不同DNA分子片段由于分子和構(gòu)型不同,在電場中的泳動速率液不同。溴化乙錠(EB)可嵌入DNA分子堿基對間形成熒光絡(luò)合物,經(jīng)紫外線照射后,可分出不同的區(qū)帶,達(dá)到分離、鑒定分子量,篩選重組子的目的。
三、實(shí)驗(yàn)材料
實(shí)驗(yàn)14提取的DNA樣品,
四、器具及藥品
電泳儀,電泳槽,紫外透射反射儀,恒溫水浴鍋,微波爐,微量進(jìn)樣器,三羥甲基氨基甲烷,鹽酸,醋酸鈉,EDTA,瓊脂糖,溴酚藍(lán),溴化乙錠。
五、實(shí)驗(yàn)步驟
1、安裝電泳槽
將有機(jī)玻璃的電泳凝膠床洗凈,晾干,用膠帶將兩端的開口封好,放在水平的工作臺上,插上樣品梳。
2、瓊脂糖凝膠的制備
稱取瓊脂糖溶解在電泳緩沖液中,(按0.3-1.5%的瓊脂糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝膠,20-100kb的DNA用0.5%的凝膠,200-2000bp的DNA用1.5%的凝膠)置微波爐或沸水浴中加熱至*溶化(不要加熱至沸騰),取出搖勻。
3、灌膠
將冷卻到60℃的瓊脂糖溶液輕輕倒入電泳槽水平板上。
4、待瓊脂糖膠凝固后,在電泳槽內(nèi)加入電泳緩沖液,然后拔出梳子。
5、加樣
將DNA樣品與加樣緩沖液按4:1混勻后,用微量移液器將混合液加到樣品槽中,每槽加10-20μl,記錄樣品的點(diǎn)樣次序和加樣量。
6、電泳
安裝好電極導(dǎo)線,點(diǎn)樣孔一端接負(fù)極,另一端接正極,打開電源,調(diào)電壓至3-5V/cm,電泳1-3hr,當(dāng)溴酚藍(lán)移到距凝膠前沿1-2cm時,停止電泳。
7、染色和觀察
取出凝膠,放在含有溴化乙錠的染色液中染色30min,即可在254nm的紫外燈下觀察,有橙紅色熒光條帶的位置,即為DNA條帶,或在紫外燈下照相記錄電泳圖譜。溴化乙錠是致癌劑,操作時要小心,必須戴手套。
附:
⑴5×TBE(tris-硼酸及EDTA)緩沖液的配制(1000ml):
Tris 54g,硼酸27.5g,0.5mol/LEDTA 20ml,將pH調(diào)到8.0,定容至1000ml,4℃冰箱保存,用時稀釋10倍。
⑵加樣緩沖液的配制:
0.25%溴酚藍(lán),40%(W/V)蔗糖水溶液,4℃冰箱保存。
⑶溴化乙錠的配制:
稱取0.1g溴化乙錠,溶于10ml水,配成終濃度為10mg/ml的母液,4℃冰箱保存。染色時,吸取12.5μl的母液,加入250ml的水中,使其終濃度為0.5μg/ml,混合均勻。
⑷100倍TE緩沖液的配制:
1mol/LTris-HCl(pH8.0),100mmol/LEDTA
稱取Tris121.1g,EDTA-Na237.23g,先用800ml雙蒸水,加熱攪拌溶解后,再用鹽酸調(diào)pH至8.0(大約加入鹽酸20ml),然后定容至1000ml。
⑸100倍電泳緩沖液的配制:
4mol/LTris-HCl(pH8..0),2mol/L醋酸鈉,200mmol/LEDTA
稱取Tris242.2g,無水乙酸鈉82.03g,EDTA-Na237.23g,先用400ml雙蒸水加熱攪拌溶解后,再用冰乙酸調(diào)pH至8.0(大約加入冰乙酸50ml),然后定容至500ml。用時稀釋100倍。